193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3051 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
242 aa  502  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  88.84 
 
 
374 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  89.26 
 
 
374 aa  448  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  89.26 
 
 
374 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  89.26 
 
 
374 aa  448  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  89.26 
 
 
374 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  88.43 
 
 
374 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  88.02 
 
 
374 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  86.78 
 
 
374 aa  437  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  55.37 
 
 
368 aa  278  7e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  46.69 
 
 
374 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  48.13 
 
 
380 aa  202  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  36.82 
 
 
369 aa  169  5e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1172  transcriptional regulator, XRE family  31.43 
 
 
372 aa  130  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.38155 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  33.08 
 
 
361 aa  95.9  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 
364 aa  91.7  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  29.3 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  50.82 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  57.14 
 
 
370 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  28.83 
 
 
348 aa  72  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  23.5 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  53.23 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  29.7 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  29.7 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  37.35 
 
 
194 aa  60.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  48.08 
 
 
436 aa  59.7  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  48.21 
 
 
276 aa  58.9  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  31.68 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  48.08 
 
 
146 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 
183 aa  58.5  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  26.81 
 
 
142 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 
205 aa  58.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  37.7 
 
 
142 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  41.54 
 
 
143 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 
380 aa  56.6  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  35.16 
 
 
149 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  44.64 
 
 
272 aa  56.2  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  35.16 
 
 
149 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 
142 aa  55.8  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  35.16 
 
 
149 aa  55.8  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  35.16 
 
 
149 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  38.36 
 
 
92 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  44.26 
 
 
328 aa  54.7  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  44.23 
 
 
145 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  35.16 
 
 
149 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 
107 aa  55.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  42.19 
 
 
293 aa  55.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 
139 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0064  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 
266 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  42.31 
 
 
200 aa  54.7  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  39.29 
 
 
210 aa  54.3  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  41.07 
 
 
459 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  32.67 
 
 
262 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  33.72 
 
 
149 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  42.31 
 
 
197 aa  53.9  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  42.31 
 
 
262 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 
134 aa  53.5  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 
197 aa  53.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  30 
 
 
196 aa  53.5  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 
200 aa  53.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 
197 aa  53.1  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
137 aa  52.4  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 
192 aa  52  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  42.59 
 
 
67 aa  52  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  35 
 
 
149 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  34.38 
 
 
186 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 
137 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  34.58 
 
 
364 aa  50.8  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  37.25 
 
 
176 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 
321 aa  50.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0054  prophage repressor protein  33.77 
 
 
114 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.515617  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 
327 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1926  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
170 aa  50.1  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 
135 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  37.1 
 
 
197 aa  50.1  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  32.88 
 
 
185 aa  50.1  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25910  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  34.38 
 
 
144 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  29.73 
 
 
198 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 
334 aa  49.7  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1627  transcriptional regulator, XRE family  29.79 
 
 
133 aa  49.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0696983 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2498  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 
474 aa  49.3  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153795 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
273 aa  48.9  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  32.99 
 
 
143 aa  48.9  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  36.54 
 
 
338 aa  48.9  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5021  XRE family transcriptional regulator  35.19 
 
 
147 aa  48.9  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621734  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 
125 aa  48.9  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 
85 aa  48.5  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 
132 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  26.8 
 
 
115 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  29.69 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 
247 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  31.43 
 
 
108 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 
71 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 
322 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  31.43 
 
 
108 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 
206 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>