135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene pE33L54_0054 on replicon NC_007105
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007105  pE33L54_0054  prophage repressor protein  100 
 
 		 114 aa  234  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.515617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  43.86 
 
 		 114 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  43.86 
 
 		 114 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  31.58 
 
 		 114 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  31.58 
 
 		 114 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4032  prophage LambdaBa02, repressor protein  30.7 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00194689  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  39.73 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  32.67 
 
 		 210 aa  53.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  27.78 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  40 
 
 		 197 aa  52.4  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 380 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  32.81 
 
 		 259 aa  52  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  36.67 
 
 		 194 aa  51.6  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 334 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  32.29 
 
 		 186 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 242 aa  50.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  35 
 
 		 436 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  32.47 
 
 		 374 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  32.47 
 
 		 374 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  32.47 
 
 		 374 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  32.47 
 
 		 374 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  34.83 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 327 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0031  transcriptional regulator, MerR family  27.19 
 
 		 211 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.60803e-35  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  32.47 
 
 		 374 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  31.15 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  31.15 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  32.47 
 
 		 374 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  30.59 
 
 		 380 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 364 aa  48.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6868  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 250 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815043  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  30.12 
 
 		 364 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1213  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 394 aa  47  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00829806  decreased coverage  0.0000499416 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  31.76 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  33.93 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1042  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.729396 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0051  putative transcriptional regulator  29.07 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0763  transcriptional regulator  30.68 
 
 		 130 aa  45.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.305784 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  31.4 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2143  helix-turn-helix domain protein  42.31 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 277 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  29.51 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3065  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 322 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  30.26 
 
 		 374 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  31.25 
 
 		 369 aa  44.7  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 189 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 358 aa  44.3  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0678  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 197 aa  44.3  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4668  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 183 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  39.62 
 
 		 328 aa  44.3  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  27.71 
 
 		 361 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  28.95 
 
 		 374 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  34.38 
 
 		 244 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 281 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  32.61 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4414  immunity repressor protein  35.48 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  32.1 
 
 		 144 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2141  helix-turn-helix domain protein  35.59 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0944  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  32.39 
 
 		 258 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2792  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 244 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 268 aa  42.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  31.75 
 
 		 196 aa  42.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 490 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 		 368 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2256  Cro/CI family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.033693 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  31.67 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  30.36 
 
 		 291 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3849  transcriptional regulator, XRE family  29.51 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0299228  normal  0.323457 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3537  transcriptional regulator, XRE family  43.24 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2738  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 95 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 131 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  36.73 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000318206  hitchhiker  0.000000295064 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0468  helix-turn-helix domain-containing protein  36.73 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  26.76 
 
 		 142 aa  42  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 72 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2711  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 112 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.256888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>