More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2840 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 176 aa  358  2e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  47.06 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  46.67 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 364 aa  65.9  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  46.27 
 
 		 459 aa  65.5  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 322 aa  65.1  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  46.88 
 
 		 262 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  46.88 
 
 		 262 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  46.15 
 
 		 262 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 262 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  39.73 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  45.59 
 
 		 205 aa  64.3  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 115 aa  63.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  43.33 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  37.66 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 380 aa  61.6  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 123 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  44.29 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  35.82 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  38.81 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  47.37 
 
 		 293 aa  57.8  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1931  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  50.94 
 
 		 352 aa  57.8  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.584244  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  38.81 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  36.07 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  30.77 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  38.27 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  36.07 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  34.18 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  35.44 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 395 aa  54.7  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 374 aa  54.7  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 359 aa  53.5  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  34.18 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  34.18 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  34.48 
 
 		 338 aa  53.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  44.26 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  30.77 
 
 		 144 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1350  DNA-binding protein  42.11 
 
 		 62 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 320 aa  53.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1889  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 203 aa  52.8  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  32.1 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 247 aa  52.4  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  38.33 
 
 		 436 aa  52.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  35.85 
 
 		 374 aa  52  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  33.64 
 
 		 149 aa  52  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 224 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 200 aa  52  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  35.85 
 
 		 374 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  35.85 
 
 		 374 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  35.85 
 
 		 374 aa  51.6  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  35.85 
 
 		 374 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  35.85 
 
 		 374 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 242 aa  52  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  36.54 
 
 		 374 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 370 aa  51.2  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 296 aa  51.2  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 374 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 277 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  37.84 
 
 		 376 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 244 aa  50.4  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0094  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 70 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0067  hypothetical protein  35 
 
 		 240 aa  50.4  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 108 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0169  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 75 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 108 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 219 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0006  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000100303  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0169  Cro/CI family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 68 aa  49.3  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0106537  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1067  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  36.51 
 
 		 111 aa  49.3  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.745753  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0505  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  36.51 
 
 		 111 aa  49.3  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.451167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  31.65 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 125 aa  49.3  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1070  cryptic phage CTXphi transcriptional repressor RstR  36.51 
 
 		 111 aa  49.3  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>