189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0730 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 85 aa  173  7e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0134  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  48.21 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  48.08 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  46.15 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  46.15 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  38.71 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  40.98 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  42.62 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0006  XRE family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 185 aa  53.9  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000100303  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  46.15 
 
 		 200 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  39.34 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  42.31 
 
 		 459 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  40 
 
 		 259 aa  51.2  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  51.06 
 
 		 293 aa  51.2  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  43.4 
 
 		 436 aa  51.2  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 277 aa  51.2  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 374 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  44.23 
 
 		 197 aa  51.2  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 273 aa  50.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 358 aa  50.8  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  42.59 
 
 		 272 aa  50.8  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 189 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  38.71 
 
 		 189 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0733  putative transcriptional regulator  37.1 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 374 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 374 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 374 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  38.46 
 
 		 374 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 374 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 374 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 368 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  45 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 197 aa  48.9  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  38.33 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0054  prophage repressor protein  36.67 
 
 		 114 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.515617  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  37.93 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 380 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  44.64 
 
 		 348 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  38.81 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 268 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  33.87 
 
 		 194 aa  48.9  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  41.07 
 
 		 374 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 374 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  47.83 
 
 		 135 aa  48.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2448  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000416057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 242 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  40.68 
 
 		 244 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 395 aa  47.8  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  30.65 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 328 aa  47.4  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3452  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.663331  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  30.65 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  38 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 380 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 369 aa  47  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 359 aa  45.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1916  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  40.43 
 
 		 296 aa  45.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  34.43 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2487  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 197 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  41.3 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 334 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0576  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016932  normal  0.922143 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0638  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000543981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1931  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  40.68 
 
 		 352 aa  45.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.584244  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 229 aa  45.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 244 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4294  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 374 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>