More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A1063 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  300  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  94.63 
 
 
149 aa  286  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  92.62 
 
 
149 aa  281  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  87.92 
 
 
149 aa  277  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  87.25 
 
 
149 aa  273  5e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  86.58 
 
 
149 aa  272  9e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  96.59 
 
 
92 aa  174  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  53.28 
 
 
143 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0957  hypothetical protein  73.85 
 
 
66 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000983228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1192  dna-binding protein  81.82 
 
 
64 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000592004  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  31.54 
 
 
206 aa  80.1  0.000000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  50.77 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  36.75 
 
 
192 aa  77.8  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  51.52 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  47.56 
 
 
334 aa  74.3  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  32.45 
 
 
322 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  44.71 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  39.82 
 
 
204 aa  71.2  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  46.27 
 
 
364 aa  70.5  0.000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  45.07 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  37.5 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  43.06 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  55 
 
 
63 aa  68.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  41.77 
 
 
312 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  39.29 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  33.63 
 
 
208 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  40.28 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 
205 aa  67  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  46.97 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  32.1 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  47.69 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  29.05 
 
 
262 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1889  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  43.53 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  43.75 
 
 
189 aa  63.9  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  44.62 
 
 
362 aa  64.3  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 
189 aa  63.9  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  45.24 
 
 
296 aa  63.9  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 
262 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  41.79 
 
 
262 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  41.46 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  41.79 
 
 
262 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 
395 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
63 aa  62.8  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 
320 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 
273 aa  62  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  35.9 
 
 
115 aa  61.6  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 
380 aa  62  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  39.24 
 
 
338 aa  62  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 
189 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  45.61 
 
 
197 aa  61.2  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  43.75 
 
 
459 aa  61.2  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 
224 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 
374 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  43.33 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 
178 aa  58.2  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 
64 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 
135 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 
210 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  32.5 
 
 
210 aa  56.6  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  37.5 
 
 
293 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  36.23 
 
 
374 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  30.71 
 
 
380 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  46.15 
 
 
197 aa  56.2  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  36.23 
 
 
374 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  33.72 
 
 
374 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  36.11 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  33.72 
 
 
374 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  33.72 
 
 
374 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  33.72 
 
 
374 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  32.08 
 
 
359 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 
361 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 
71 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 
85 aa  54.3  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 
321 aa  54.7  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  27.59 
 
 
276 aa  54.3  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  35.71 
 
 
108 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  35.71 
 
 
108 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  36.92 
 
 
194 aa  54.3  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 
368 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  46.3 
 
 
68 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0134  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 
104 aa  53.9  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 
231 aa  54.3  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  33.72 
 
 
242 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 
115 aa  53.9  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 
115 aa  53.9  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 
163 aa  53.9  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  48.15 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5030  transcriptional regulator, XRE family  38.16 
 
 
189 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.565327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 
71 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  36.47 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1025  putative transcriptional regulator  40.32 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  37.97 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  45.28 
 
 
436 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>