More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0776 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 
123 aa  254  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  70.18 
 
 
118 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  69.64 
 
 
115 aa  156  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  44.44 
 
 
301 aa  64.7  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  47.62 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 
321 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3849  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 
87 aa  61.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0299228  normal  0.323457 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  36.9 
 
 
137 aa  61.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  38.36 
 
 
114 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  38.36 
 
 
114 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  44.44 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 
268 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  49.15 
 
 
176 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  43.33 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 
208 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
192 aa  58.5  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  38.27 
 
 
104 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  39.44 
 
 
200 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  37.5 
 
 
92 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  37.5 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  33.82 
 
 
108 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  40 
 
 
149 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  33.82 
 
 
108 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  40 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  40 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  40 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  40.28 
 
 
227 aa  55.1  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  36.92 
 
 
355 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  43.75 
 
 
459 aa  54.7  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  40.62 
 
 
145 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  39.44 
 
 
296 aa  54.3  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  33.04 
 
 
312 aa  54.3  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  43.33 
 
 
200 aa  54.3  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4032  prophage LambdaBa02, repressor protein  40.62 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00194689  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 
231 aa  53.5  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  33.8 
 
 
114 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  33.8 
 
 
114 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 
380 aa  53.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 
205 aa  52.8  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 
374 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 
261 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2814  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  35 
 
 
359 aa  52  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  32.91 
 
 
371 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 
114 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1190  transcriptional regulator, XRE family  31.73 
 
 
126 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815543  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  31.11 
 
 
206 aa  51.6  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0433  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 
215 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 
178 aa  51.6  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  36.07 
 
 
369 aa  51.6  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 
358 aa  51.2  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 
395 aa  51.2  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  30.97 
 
 
215 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  41.67 
 
 
436 aa  51.6  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
223 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 
115 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 
115 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 
206 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 
181 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 
273 aa  50.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15940  predicted transcriptional regulator  40.98 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0473945  hitchhiker  0.000000239728 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5705  transcriptional regulator, XRE family  31.62 
 
 
139 aa  50.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.712971 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  30.36 
 
 
338 aa  50.8  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 
135 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  41.43 
 
 
293 aa  50.4  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  37.1 
 
 
181 aa  50.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 
113 aa  50.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 
123 aa  50.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3286  DNA-binding protein  37.1 
 
 
179 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
189 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 
195 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  35.94 
 
 
189 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  40.68 
 
 
196 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 
334 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0229  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.790112  hitchhiker  0.00100096 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 
380 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  25.23 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1931  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  45.61 
 
 
352 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.584244  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 
206 aa  48.9  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  35.59 
 
 
197 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1852  Cro/CI family transcriptional regulator  31.63 
 
 
642 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 
210 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  35.8 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
203 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0068  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 
229 aa  48.5  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>