122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5705 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5705  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 139 aa  271  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.712971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4304  transcriptional regulator, XRE family  50.41 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.663644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  49.59 
 
 		 140 aa  110  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6836  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 199 aa  106  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5877  transcriptional regulator, XRE family  48.78 
 
 		 133 aa  90.1  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00666894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0063  transcriptional regulator, XRE family  46.34 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4456  transcriptional regulator, XRE family  46.34 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6835  transcriptional regulator, XRE family  35.51 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6461  transcriptional regulator, XRE family  53.62 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2893  transcriptional regulator, XRE family  44.29 
 
 		 70 aa  67.8  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0147391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0731  transcriptional regulator, XRE family  44.29 
 
 		 70 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.228536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0677  transcriptional regulator, XRE family  44.29 
 
 		 70 aa  67  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1091  transcriptional regulator, XRE family  44.29 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0579  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00759938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0570  transcriptional regulator, XRE family  42.25 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.532171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1190  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2822  transcriptional regulator, XRE family  46.77 
 
 		 80 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1224  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 79 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0288237  hitchhiker  0.00260767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6604  transcriptional regulator, XRE family  38.05 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.608837  normal  0.251603 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  27.59 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  31.62 
 
 		 123 aa  50.4  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2793  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  45.31 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2402  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.314707  normal  0.620084 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  30.99 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 513 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  45.31 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  38.57 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2696  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  29.31 
 
 		 495 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0309  helix-turn-helix domain protein  41.54 
 
 		 263 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0189461  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3025  XRE family transcriptional regulator  46 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314698  normal  0.932142 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  26.79 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0921  Tn916, transcriptional regulator, putative  35.59 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  33.87 
 
 		 348 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  29.31 
 
 		 504 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  46 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2078  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0127791  hitchhiker  0.00785585 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4238  XRE family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0673449  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3096  transcriptional regulator, XRE family  30.88 
 
 		 192 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00124629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  37.7 
 
 		 255 aa  43.5  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 293 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0716  DNA-binding protein  49.02 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1900  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.43236e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 192 aa  42.7  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2711  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 112 aa  42.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.256888  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  39.29 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1826  transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0685  Cro/CI family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5917  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.33 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4548  helix-turn-helix domain-containing protein  25.76 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4588  XRE family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 286 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000221272 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0954  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5469  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381278  normal  0.011752 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2729  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  33.01 
 
 		 302 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  36.96 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  35.48 
 
 		 327 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  30.67 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 199 aa  41.6  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  45.1 
 
 		 508 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4271  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 68 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4410  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 68 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 110 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  36.76 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 191 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4302  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.397769  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1519  transcriptional regulator, XRE family  30.51 
 
 		 109 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0937641 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1531  XRE family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 189 aa  41.2  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000256618  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4994  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.660865  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1027  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 223 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  28.74 
 
 		 355 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2769  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2461  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000100603  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  37.88 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3438  putative transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 321 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00198305  normal  0.0571393 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1224  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000350167  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2874  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6814  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>