213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3438 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3438  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 321 aa  625  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00198305  normal  0.0571393 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1997  transcriptional regulator, XRE family  59.29 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  38.6 
 
 		 291 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  36.84 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 310 aa  139  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  39.16 
 
 		 302 aa  139  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  38.91 
 
 		 276 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  36.04 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  39.64 
 
 		 275 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2804  putative transcriptional regulator, XRE family  36.77 
 
 		 300 aa  135  9e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  37.46 
 
 		 302 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  38.93 
 
 		 273 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  39.78 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  35.16 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  35.64 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  41.3 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  39.02 
 
 		 278 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  36.19 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  39.78 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  36.63 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  41.35 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  34.43 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  37.27 
 
 		 287 aa  123  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  32.82 
 
 		 334 aa  122  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  40.98 
 
 		 289 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  37.35 
 
 		 284 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  37.79 
 
 		 282 aa  122  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  37.17 
 
 		 287 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  35.56 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4458  transcriptional regulator, XRE family  36.7 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  37.26 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  35.64 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7525  helix-turn-helix domain protein  35.19 
 
 		 294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.507002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  36.26 
 
 		 307 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 288 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19630  Helix-turn-helix protein  35.77 
 
 		 288 aa  119  7.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.879989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 283 aa  119  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0368  transcriptional regulator, XRE family  37.69 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  36.71 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3700  transcriptional regulator, XRE family  35.85 
 
 		 273 aa  116  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.564208  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  39.56 
 
 		 280 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  34.4 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4317  helix-turn-helix domain protein  36.55 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4092  XRE family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  35.58 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4741  XRE family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 263 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3425  XRE family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 263 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1956  putative transcriptional regulator, XRE family  35.27 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  34.11 
 
 		 318 aa  113  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  37.16 
 
 		 280 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  35.74 
 
 		 314 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  38.55 
 
 		 280 aa  112  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3112  helix-turn-helix domain protein  38.99 
 
 		 279 aa  112  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000518579 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  34.03 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  35.84 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  38.43 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  34.39 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2579  helix-turn-helix domain protein  35.89 
 
 		 328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0930  helix-turn-helix domain-containing protein  37.74 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  34.31 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  34.04 
 
 		 298 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  37.85 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  34.28 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  34.69 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14230  Helix-turn-helix protein  38.43 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.814537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  35.78 
 
 		 303 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  35.56 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2718  helix-turn-helix domain protein  34.15 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.479107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  36.15 
 
 		 297 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 304 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4541  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  34.32 
 
 		 301 aa  105  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  33.77 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8805  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2807  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 289 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1995  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000234374  normal  0.041772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  35.48 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3211  XRE family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 263 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.663604  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4588  XRE family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000221272 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2494  helix-turn-helix domain protein  36.2 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106258  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2137  helix-turn-helix domain protein  33.7 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.291672  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 284 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 289 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 289 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4188  transcriptional regulator, XRE family  34.64 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  34.36 
 
 		 287 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4269  helix-turn-helix domain protein  39.46 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0718578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2024  putative transcriptional regulator, XRE family  35.83 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>