More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5795 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  100 
 
 		 154 aa  317  5e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  88.31 
 
 		 154 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  70.69 
 
 		 76 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00126  predicted transcriptional regulator  52.11 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4798  hypothetical protein  49.32 
 
 		 72 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.862286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  53.33 
 
 		 72 aa  71.2  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  53.33 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3768  hypothetical protein  45.33 
 
 		 326 aa  70.5  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.689278  normal  0.921006 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  46.97 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5087  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 78 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000142264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  46.97 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3834  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0368  XRE family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  42.86 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0172  XRE family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134297  normal  0.353283 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1799  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2329  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.632323  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  45.76 
 
 		 72 aa  57  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  45.76 
 
 		 72 aa  57  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  51.85 
 
 		 70 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  38.81 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3342  putative transcriptional regulatory protein  41.18 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0179651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0504  transcriptional regulator  45.16 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  46.97 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  34.78 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  39.71 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1848  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  38.24 
 
 		 186 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  42.42 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0577  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0298135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3542  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0965  XRE family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476266  normal  0.0356883 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  38.24 
 
 		 186 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  38.24 
 
 		 186 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5402  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 186 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  38.24 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  38.24 
 
 		 186 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0713  ribulose-phosphate 3-epimerase  33.87 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.625561 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 84 aa  51.2  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  43.33 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0716  DNA-binding protein  41.18 
 
 		 90 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0914  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 96 aa  50.8  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2077  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 81 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1868  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 81 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1992  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 81 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1357  helix-turn-helix domain-containing protein  36.67 
 
 		 76 aa  50.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.222468  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 390 aa  49.7  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 97 aa  50.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  41.67 
 
 		 196 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0130  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0877719  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3171  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3368  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6563  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 90 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  40 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 199 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.910423 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5920  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0999  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  46.27 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 195 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4522  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0078  hypothetical protein  39.06 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3538  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.902272  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3860  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  42.19 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 81 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  42.19 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  42.19 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>