59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6814 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6814  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 102 aa  202  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1547  XRE family transcriptional regulator  65.35 
 
 		 102 aa  116  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.358445  normal  0.0388732 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5804  XRE family transcriptional regulator  64.36 
 
 		 101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.365754  normal  0.0338567 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0688  XRE family transcriptional regulator  60.64 
 
 		 110 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  48.39 
 
 		 383 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_003296  RS01906  hypothetical protein  37.97 
 
 		 180 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.610922  normal  0.293874 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4620  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 		 177 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157225  normal  0.499919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4487  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 		 177 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1872  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.765913  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3478  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3380  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.738813  hitchhiker  0.00256975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3350  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3247  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4900  hypothetical protein  33.82 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.978216  normal  0.040659 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1622  transcriptional regulator, XRE family  32.56 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2252  XRE family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00411497  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0549  transcriptional regulator, XRE family  30.14 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04053  Transcriptional Regulator, XRE family protein  30.14 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1125  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4373  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00851296  normal  0.949544 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3922  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.1 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  36.05 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  36.05 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  36.05 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  36.05 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  36.05 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  36.05 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001517  predicted transcriptional regulator  33.87 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000562754  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5660  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 490 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176576  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3687  transcriptional regulator, XRE family  34.21 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  28.36 
 
 		 264 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0914  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28980  predicted transcriptional regulator  36.56 
 
 		 382 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.645932 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2290  hypothetical protein  35.09 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1892  XRE family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 120 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0540  XRE family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 120 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2426  hypothetical protein  33.33 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 806 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 191 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 198 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0675  XRE family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 120 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00325967 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5431  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.716387  normal  0.867638 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  31.88 
 
 		 251 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3025  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314698  normal  0.932142 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 272 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0127  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4570  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.27714 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  27.59 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 191 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5705  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.712971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>