60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1125 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1125  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 104 aa  208  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0549  transcriptional regulator, XRE family  52.43 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04053  Transcriptional Regulator, XRE family protein  51.89 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1872  XRE family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.765913  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3350  XRE family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3247  XRE family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3478  XRE family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3380  XRE family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.738813  hitchhiker  0.00256975 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4570  XRE family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.27714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1622  transcriptional regulator, XRE family  32.22 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2252  XRE family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00411497  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4562  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00197637  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0688  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2425  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4679  putative transcriptional regulator  44.64 
 
 		 180 aa  46.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  43.86 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  43.86 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6814  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 182 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 205 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3013  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4900  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.978216  normal  0.040659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 208 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 208 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 208 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  42.11 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.99 
 
 		 199 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001517  predicted transcriptional regulator  35.71 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000562754  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_003296  RS01906  hypothetical protein  28.92 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.610922  normal  0.293874 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4620  transcriptional regulator, XRE family  28.75 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157225  normal  0.499919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 199 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1386  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4487  transcriptional regulator, XRE family  28.75 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2898  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0504  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0105  DNA-binding protein  31.96 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 182 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  57.14 
 
 		 60 aa  41.6  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1442  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 103 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69980  putative transcriptional regulator  40.35 
 
 		 182 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 252 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6075  putative transcriptional regulator  40.35 
 
 		 182 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47950  Cupin, RmlC-type protein  41.51 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0983  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.525138  normal  0.0218109 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  30.14 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4784  transcriptional regulator, XRE family  32.53 
 
 		 182 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0510271 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0080  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 195 aa  40.4  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0107251  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4834  transcriptional regulator, XRE family  32.53 
 
 		 182 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.197047  normal  0.0345523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>