76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2898 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2898  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 83 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  67.47 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0567  XRE family transcriptional regulator  50.63 
 
 		 82 aa  76.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.102591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2442  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 86 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2034  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.194194 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003247  putative transcription regulator protein  44.78 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3847  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0065  hypothetical protein  37.97 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0496  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4613  helix-turn-helix domain protein  36 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.590277  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4245  helix-turn-helix domain protein  38.24 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0306  transciptional regulator  39.71 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93162  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  39.71 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0365  helix-turn-helix domain-containing protein  39.71 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03585  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 206 aa  51.6  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  32.1 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  32.1 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4032  helix-turn-helix domain protein  36.25 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.964235  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  32.1 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  32.1 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  32.1 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  32.1 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5258  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0367  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5634  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909222  normal  0.150315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3420  transcriptional regulator, XRE family  31.34 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.964582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4302  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.397769  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0634  HipB domain-containing protein  36.51 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29949  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0094  transcriptional regulator, XRE family  26.92 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.850445  normal  0.0181777 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4574  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000193925 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4154  hypothetical protein  43.33 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2003  HipB domain-containing protein  36.51 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2236  putative transcriptionl regulator HipB  36.51 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.74282  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0549  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1592  HipB domain-containing protein  36.51 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20520  DNA binding protein, XRE family  29.85 
 
 		 76 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04053  Transcriptional Regulator, XRE family protein  37.5 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2151  putative transcriptionl regulator HipB  36.51 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0681  putative transcriptionl regulator HipB  36.51 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1801  DNA-binding transcriptional regulator HipB  29.87 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0789  HipB domain-containing protein  35.82 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107176  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  33.85 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0291  helix-turn-helix domain protein  33.82 
 
 		 92 aa  43.5  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  37.5 
 
 		 508 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001517  predicted transcriptional regulator  36.36 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000562754  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2300  XRE family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4676  normal  0.0781395 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2487  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3350  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3247  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1872  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.765913  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2661  putative transcription regulator protein  30.88 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.574569 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3478  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4570  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.27714 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1125  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 104 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 74 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3808  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0020912  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3380  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 115 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.738813  hitchhiker  0.00256975 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 76 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0140  helix-turn-helix domain protein  29.41 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.7168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2611  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0796411  hitchhiker  0.0000000000000114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2577  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0918178  hitchhiker  0.000133769 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0377  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1916  transcriptional regulator, XRE family  27.87 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193475  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0415  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187389  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2078  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0127791  hitchhiker  0.00785585 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3687  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  34.38 
 
 		 240 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  33.93 
 
 		 517 aa  40.4  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  34.38 
 
 		 240 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0376  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 82 aa  40  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000453716 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13300  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  35.71 
 
 		 509 aa  40  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.801467  normal  0.209244 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>