59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001517 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001517  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 84 aa  172  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000562754  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003247  putative transcription regulator protein  37.88 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2034  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.194194 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0549  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1535  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  46.55 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1414  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  46.55 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1509  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  46.55 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2326  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  46.55 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1823  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  46.55 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706879 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1941  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  46.55 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.385308 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01287  hypothetical protein  46.55 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2347  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204857  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01276  DNA-binding transcriptional repressor  46.55 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2727  DNA-binding transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118237 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04053  Transcriptional Regulator, XRE family protein  44.64 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  35.94 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  35.94 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  35.94 
 
 		 94 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  35.94 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  35.94 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0950  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 207 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0367  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0065  hypothetical protein  32.84 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0914  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05970  hypothetical protein  36.67 
 
 		 207 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2066  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  44.83 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0567  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.102591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 219 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 219 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4897  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 219 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1125  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0306  transciptional regulator  33.33 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93162  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1801  DNA-binding transcriptional regulator HipB  32.31 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0365  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3847  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 93 aa  43.5  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000231  predicted transcriptional regulator  36.67 
 
 		 207 aa  43.5  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0496  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 103 aa  43.5  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6814  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 213 aa  42.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2898  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4302  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.397769  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4613  helix-turn-helix domain protein  30.56 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.590277  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0763  putative DNA-binding protein  34.62 
 
 		 215 aa  41.6  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 196 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5469  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 215 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381278  normal  0.011752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 200 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3217  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  41.38 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931444 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  38 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2484  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0499056 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 219 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 198 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4798  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 222 aa  40.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 513 aa  40.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4032  helix-turn-helix domain protein  26.47 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.964235  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 195 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0669  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2858  transcriptional regulator, XRE family  42 
 
 		 215 aa  40  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000622832  normal  0.0374075 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>