72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0983 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0983  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 80 aa  153  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.525138  normal  0.0218109 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  51.32 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0717  DNA-binding protein  44.74 
 
 		 80 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3550  XRE family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0545283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3635  XRE family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.314503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1813  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.464134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2731  DNA-binding protein  43.04 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0622  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.03 
 
 		 80 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831827  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3970  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0810  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3691  XRE family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5654  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.279432  normal  0.298954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7321  transcriptional regulator, XRE family  41.1 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000062062  decreased coverage  0.00000000166173 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2410  XRE family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000194776  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0800  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1559  DNA-binding protein  40.28 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810667  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1246  DNA-binding protein  40.28 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2441  DNA-binding protein  40.28 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1707  DNA-binding protein  40.28 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3194  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0743  DNA-binding protein  40.28 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0719  DNA-binding protein  40.28 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196932  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5908  helix-turn-helix domain protein  44.74 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.84632  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2106  hypothetical protein  40.62 
 
 		 84 aa  50.4  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6264  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0000184029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  35.71 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4916  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.366268  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0099  DNA-binding protein  37.88 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0039  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.514774  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03892  DNA-binding protein  44.23 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  39.62 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3948  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697178 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  39.62 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  35.59 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1909  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0903  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 410 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1080  XRE family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 103 aa  43.5  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1462  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0127  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1505  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139126  normal  0.0361039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3256  helix-turn-helix domain-containing protein  40.98 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0834  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.259279 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0084  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 109 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0902  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 82 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2077  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 81 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  32.81 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1992  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 81 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  35.59 
 
 		 90 aa  41.2  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1868  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 81 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2581  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 271 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0870  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1125  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3331  putative transcription regulator protein  42.86 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3955  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  33.96 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  33.96 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 380 aa  40.4  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0094  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.850445  normal  0.0181777 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  31.34 
 
 		 227 aa  40  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 95 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1022  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 75 aa  40  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 112 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.910423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>