57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3691 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3691  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 85 aa  168  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3194  XRE family transcriptional regulator  81.93 
 
 		 86 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2731  DNA-binding protein  77.65 
 
 		 85 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989155  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2410  XRE family transcriptional regulator  63.86 
 
 		 88 aa  105  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000194776  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0717  DNA-binding protein  46.48 
 
 		 80 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1813  helix-turn-helix domain-containing protein  48.05 
 
 		 80 aa  71.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.464134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0622  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  45.07 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831827  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4916  XRE family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.366268  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5654  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.279432  normal  0.298954 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  43.06 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1324  helix-turn-helix domain-containing protein  44.93 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0983  transcriptional regulator, XRE family  40.51 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.525138  normal  0.0218109 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3550  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0545283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0800  XRE family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0902  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0810  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5908  helix-turn-helix domain protein  41.67 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.84632  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0903  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2106  hypothetical protein  40.91 
 
 		 84 aa  53.5  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1926  XRE family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.616703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3955  XRE family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7321  transcriptional regulator, XRE family  41.33 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000062062  decreased coverage  0.00000000166173 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1469  Cro/CI family transcriptional regulator  35 
 
 		 84 aa  50.4  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3635  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.314503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  47.92 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2441  DNA-binding protein  31.51 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1559  DNA-binding protein  31.51 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810667  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1246  DNA-binding protein  31.51 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0743  DNA-binding protein  31.51 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0719  DNA-binding protein  31.51 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196932  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1022  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1707  DNA-binding protein  31.51 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03892  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 497 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5384  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 185 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  normal  0.424249 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4902  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.634753 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4279  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3464  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2181  Cro/CI family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4807  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3556  XRE family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0638  putative transcriptional regulator  48.98 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0803  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2635  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1788  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3948  XRE family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5660  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 490 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176576  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3720  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 200 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.310668  normal  0.0265405 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6264  XRE family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 188 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0000184029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3970  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 85 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06970  Cro/CI family transcriptional regulator  50 
 
 		 184 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2410  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 141 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000774173  normal  0.481646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1784  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3560  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4563  transcriptional regulator, XRE family  31.17 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0127  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2177  transcriptional regulator, putative  36.62 
 
 		 184 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>