67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7321 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7321  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 77 aa  155  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000062062  decreased coverage  0.00000000166173 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  42.47 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0800  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0903  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1324  helix-turn-helix domain-containing protein  47.69 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0622  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.47 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831827  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1813  helix-turn-helix domain-containing protein  45.21 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.464134  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0717  DNA-binding protein  42.47 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3550  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0545283  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1469  Cro/CI family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2106  hypothetical protein  49.12 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0983  transcriptional regulator, XRE family  41.1 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.525138  normal  0.0218109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4916  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 81 aa  57  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.366268  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2410  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000194776  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2731  DNA-binding protein  39.73 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989155  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0902  transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3691  XRE family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3970  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5654  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.279432  normal  0.298954 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0810  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 85 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5908  helix-turn-helix domain protein  40.28 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.84632  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3194  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3948  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697178 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3635  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.314503 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03892  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1022  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  32.43 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 197 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17240  predicted transcriptional regulator  42.62 
 
 		 242 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3955  XRE family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 72 aa  43.5  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5660  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 490 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176576  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0143  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 825 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.514651 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2248  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4582  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.752323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0513  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.041665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 321 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 205 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1458  transcriptional regulator, XRE family  32.88 
 
 		 114 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 70 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2300  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0137231  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0743  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0719  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196932  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2441  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1559  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810667  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1707  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1246  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 364 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 		 201 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4067  helix-turn-helix domain-containing protein  43.64 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.563451 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3124  XRE family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 76 aa  40.8  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2421  XRE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0970  hypothetical protein  30.43 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0316  helix-turn-helix domain-containing protein  28.33 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0309  XRE family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.793931  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 123 aa  40.4  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 497 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 179 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1133  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.73 
 
 		 114 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.96581  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 67 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>