65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2731 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I2731  DNA-binding protein  100 
 
 		 85 aa  169  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3691  XRE family transcriptional regulator  77.65 
 
 		 85 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3194  XRE family transcriptional regulator  77.11 
 
 		 86 aa  130  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2410  XRE family transcriptional regulator  60.24 
 
 		 88 aa  103  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000194776  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0717  DNA-binding protein  47.89 
 
 		 80 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0622  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  46.48 
 
 		 80 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831827  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4916  XRE family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.366268  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1813  helix-turn-helix domain-containing protein  42.31 
 
 		 80 aa  70.1  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.464134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5654  transcriptional regulator, XRE family  44 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.279432  normal  0.298954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0983  transcriptional regulator, XRE family  43.04 
 
 		 80 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.525138  normal  0.0218109 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0903  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1324  helix-turn-helix domain-containing protein  41.56 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3550  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0545283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  40.28 
 
 		 81 aa  60.1  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0800  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0902  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1707  DNA-binding protein  36.84 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0719  DNA-binding protein  36.84 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196932  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0743  DNA-binding protein  36.84 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1559  DNA-binding protein  36.84 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810667  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1246  DNA-binding protein  36.84 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2441  DNA-binding protein  36.84 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5908  helix-turn-helix domain protein  44.44 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.84632  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3955  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0810  XRE family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7321  transcriptional regulator, XRE family  39.73 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000062062  decreased coverage  0.00000000166173 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2106  hypothetical protein  36.36 
 
 		 84 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1022  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3635  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.314503 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03892  DNA-binding protein  42.03 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4563  transcriptional regulator, XRE family  37.18 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6264  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 188 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0000184029  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1469  Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3970  XRE family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1926  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 82 aa  48.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.616703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3948  XRE family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697178 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 497 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3599  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 407 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34153  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3359  helix-turn-helix domain-containing protein  41.67 
 
 		 407 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 205 aa  44.3  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.86 
 
 		 284 aa  42.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0127  XRE family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5660  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 490 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176576  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 513 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 		 503 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0803  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1542  hypothetical protein  42.86 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  37.25 
 
 		 101 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2410  transcriptional regulator, XRE family  32.89 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000774173  normal  0.481646 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5384  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  normal  0.424249 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4279  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3464  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4902  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.634753 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1080  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4807  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1801  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.24 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2430  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 276 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2018  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 83 aa  40  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.97795  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0549  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 103 aa  40  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1336  helix-turn-helix domain-containing protein  41.67 
 
 		 225 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1661  helix-turn-helix domain-containing protein  41.67 
 
 		 225 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0638  putative transcriptional regulator  36.99 
 
 		 184 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>