46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0903 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0903  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 77 aa  156  9e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0902  transcriptional regulator, XRE family  66.67 
 
 		 82 aa  107  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0717  DNA-binding protein  48.65 
 
 		 80 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0622  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  48.65 
 
 		 80 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831827  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5654  transcriptional regulator, XRE family  42.67 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.279432  normal  0.298954 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3550  XRE family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0545283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0800  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7321  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000062062  decreased coverage  0.00000000166173 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2731  DNA-binding protein  38.89 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989155  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  46.43 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1324  helix-turn-helix domain-containing protein  38.67 
 
 		 85 aa  60.1  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0810  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1813  helix-turn-helix domain-containing protein  44 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.464134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4916  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.366268  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2106  hypothetical protein  49.02 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3970  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3691  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3948  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697178 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0970  hypothetical protein  64.86 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5908  helix-turn-helix domain protein  42.19 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.84632  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3955  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3194  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 86 aa  50.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3635  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.314503 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  40.58 
 
 		 370 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2018  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 83 aa  48.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.97795  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1246  DNA-binding protein  35.82 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1559  DNA-binding protein  35.82 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810667  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2441  DNA-binding protein  35.82 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1707  DNA-binding protein  35.82 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5660  XRE family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 490 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176576  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0743  DNA-binding protein  35.82 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0719  DNA-binding protein  35.82 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196932  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2410  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000194776  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 497 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5565  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03892  DNA-binding protein  40.74 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5293  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0983  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.525138  normal  0.0218109 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1469  Cro/CI family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6198  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04053  Transcriptional Regulator, XRE family protein  38.6 
 
 		 106 aa  43.5  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1891  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00988673  normal  0.0163804 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 81 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 		 513 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0549  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6264  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0000184029  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>