31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3955 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3955  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 84 aa  172  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0902  transcriptional regulator, XRE family  33.77 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2731  DNA-binding protein  43.75 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989155  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0717  DNA-binding protein  41.79 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3970  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3691  XRE family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2410  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000194776  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5654  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 78 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.279432  normal  0.298954 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4770  protein of unknown function DUF955  36.9 
 
 		 399 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.166779  hitchhiker  0.00150402 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0622  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.75 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831827  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3194  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0903  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  44.23 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4067  helix-turn-helix domain-containing protein  37.1 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.563451 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0800  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2567  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.59456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1813  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.464134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7321  transcriptional regulator, XRE family  53.66 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000062062  decreased coverage  0.00000000166173 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3635  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.314503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7699  putative transcriptional regulator  40.38 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829097  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2106  hypothetical protein  52.27 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3550  XRE family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0545283  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1469  Cro/CI family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3948  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697178 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03892  DNA-binding protein  36.54 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0983  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.525138  normal  0.0218109 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  35.42 
 
 		 370 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 410 aa  40.8  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1559  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 80 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810667  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2441  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 80 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1246  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 80 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>