48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3194 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3194  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 86 aa  170  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3691  XRE family transcriptional regulator  81.93 
 
 		 85 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2731  DNA-binding protein  77.11 
 
 		 85 aa  130  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989155  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2410  XRE family transcriptional regulator  63.86 
 
 		 88 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000194776  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0717  DNA-binding protein  47.89 
 
 		 80 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0622  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  46.48 
 
 		 80 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831827  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4916  XRE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.366268  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1813  helix-turn-helix domain-containing protein  48.48 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.464134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0800  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1324  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5654  transcriptional regulator, XRE family  45.21 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.279432  normal  0.298954 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3550  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0545283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  41.18 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0810  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 85 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1559  DNA-binding protein  36.49 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810667  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2441  DNA-binding protein  36.49 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1246  DNA-binding protein  36.49 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0902  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0719  DNA-binding protein  36.49 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196932  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0743  DNA-binding protein  36.49 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1707  DNA-binding protein  36.49 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1469  Cro/CI family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0983  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.525138  normal  0.0218109 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5908  helix-turn-helix domain protein  41.43 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.84632  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3955  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3635  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.314503 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2106  hypothetical protein  39.06 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0903  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 		 77 aa  50.1  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03892  DNA-binding protein  39.73 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7321  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000062062  decreased coverage  0.00000000166173 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3970  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4563  transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1022  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2177  transcriptional regulator, putative  38.71 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3948  XRE family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06970  Cro/CI family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 184 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0638  putative transcriptional regulator  36.99 
 
 		 184 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3560  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 184 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1784  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 184 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 497 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1661  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 225 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 513 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1336  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 225 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1788  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3556  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2181  Cro/CI family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2163  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 710 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>