40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5654 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5654  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 78 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.279432  normal  0.298954 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3970  XRE family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3635  XRE family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.314503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1813  helix-turn-helix domain-containing protein  49.35 
 
 		 80 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.464134  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0717  DNA-binding protein  47.95 
 
 		 80 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0622  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  47.95 
 
 		 80 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831827  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0810  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 85 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  47.22 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0800  XRE family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 97 aa  66.6  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3550  XRE family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0545283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4916  XRE family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.366268  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0902  transcriptional regulator, XRE family  46.05 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0903  transcriptional regulator, XRE family  42.67 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2731  DNA-binding protein  44 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3691  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3194  XRE family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0983  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.525138  normal  0.0218109 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2106  hypothetical protein  50.88 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2410  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000194776  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1324  helix-turn-helix domain-containing protein  41.18 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3955  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7321  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000062062  decreased coverage  0.00000000166173 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1246  DNA-binding protein  34.67 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1559  DNA-binding protein  34.67 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810667  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2441  DNA-binding protein  34.67 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1707  DNA-binding protein  34.67 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0743  DNA-binding protein  34.67 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0719  DNA-binding protein  34.67 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196932  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 497 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3948  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 73 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5660  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 490 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176576  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5908  helix-turn-helix domain protein  41.79 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.84632  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6264  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0000184029  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1469  Cro/CI family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1926  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.616703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4563  transcriptional regulator, XRE family  31.17 
 
 		 80 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  48.08 
 
 		 201 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  36.07 
 
 		 90 aa  40  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>