56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2410 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2410  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 88 aa  176  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000194776  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3691  XRE family transcriptional regulator  63.86 
 
 		 85 aa  105  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3194  XRE family transcriptional regulator  63.86 
 
 		 86 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2731  DNA-binding protein  60.24 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989155  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1813  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 80 aa  64.3  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.464134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0622  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.85 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831827  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  48.39 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0717  DNA-binding protein  39.44 
 
 		 80 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0810  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1324  helix-turn-helix domain-containing protein  45.31 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1469  Cro/CI family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7321  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000062062  decreased coverage  0.00000000166173 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0983  transcriptional regulator, XRE family  40.48 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.525138  normal  0.0218109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4916  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.366268  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0800  XRE family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1926  XRE family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.616703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5654  transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.279432  normal  0.298954 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3550  XRE family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0545283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3955  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0902  transcriptional regulator, XRE family  29.11 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3970  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0903  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5908  helix-turn-helix domain protein  42.86 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.84632  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1480  transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.204155  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1559  DNA-binding protein  34.25 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810667  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2441  DNA-binding protein  34.25 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1246  DNA-binding protein  34.25 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0719  DNA-binding protein  34.25 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1707  DNA-binding protein  34.25 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0743  DNA-binding protein  34.25 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 410 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3290  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605967 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03892  DNA-binding protein  39.73 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3635  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.314503 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01955  hypothetical protein  35.09 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 474 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1022  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3281  transcriptional regulator, XRE family  52.94 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.871806 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3948  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 73 aa  42  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697178 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2248  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 116 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529166 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 154 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 291 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2106  hypothetical protein  44.44 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2818  transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 		 173 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  44.9 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3201  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000878656  hitchhiker  0.0000000379296 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0127  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  40.68 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1808  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0459623  normal  0.163421 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl455  Cro/CI family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.33845e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>