31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01955 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01955  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  183  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3398  XRE family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1854  XRE family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214862  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1971  XRE family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0320655  normal  0.0438636 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2989  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1211  XRE family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 71 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3982  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000105146  normal  0.107406 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1405  hypothetical protein  38.46 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00110719  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0251  Cro/CI family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  48.21 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  38.1 
 
 		 377 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0777  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000109093  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4362  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  37.5 
 
 		 377 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2410  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000194776  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1922  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 128 aa  42.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.243972  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1916  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0744  transcriptional regulator  34.92 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 184 aa  42  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  58.82 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 464 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0575  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3281  transcriptional regulator, XRE family  43.18 
 
 		 173 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.871806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2818  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 173 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  32.88 
 
 		 94 aa  40  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  40.48 
 
 		 118 aa  40  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 145 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>