47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03892 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03892  DNA-binding protein  100 
 
 		 82 aa  164  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0717  DNA-binding protein  54.24 
 
 		 80 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5908  helix-turn-helix domain protein  45.45 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.84632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0622  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  50.85 
 
 		 80 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831827  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4563  transcriptional regulator, XRE family  52.46 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2441  DNA-binding protein  43.84 
 
 		 80 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1246  DNA-binding protein  43.84 
 
 		 80 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1559  DNA-binding protein  43.84 
 
 		 80 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810667  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2106  hypothetical protein  44.44 
 
 		 84 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4916  XRE family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.366268  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7321  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000062062  decreased coverage  0.00000000166173 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0719  DNA-binding protein  42.47 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196932  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1469  Cro/CI family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0743  DNA-binding protein  42.47 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1707  DNA-binding protein  42.47 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2731  DNA-binding protein  42.03 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989155  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0903  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0902  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3194  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3948  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697178 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  36.62 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6264  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 188 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0000184029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2410  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000194776  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3550  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0545283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0800  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3691  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0983  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.525138  normal  0.0218109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1324  helix-turn-helix domain-containing protein  45.45 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3955  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1813  helix-turn-helix domain-containing protein  38.24 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.464134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 230 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3970  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1141  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.519816  normal  0.304239 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  40.85 
 
 		 186 aa  43.9  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4878  transcriptional regulator, XRE family  55 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  38.18 
 
 		 517 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 120 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 77 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5654  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.279432  normal  0.298954 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2018  XRE family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.97795  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2325  helix-turn-helix domain-containing protein  39.29 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665096  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0810  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  31.25 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>