69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0810 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0810  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 85 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3635  XRE family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 85 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.314503 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3970  XRE family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0800  XRE family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5654  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 78 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.279432  normal  0.298954 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3550  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0545283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  42.47 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1813  helix-turn-helix domain-containing protein  36.99 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.464134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1324  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 85 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0622  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.49 
 
 		 80 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831827  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0983  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.525138  normal  0.0218109 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2410  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000194776  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0717  DNA-binding protein  35.62 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4916  XRE family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.366268  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1707  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0719  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196932  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0743  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0903  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0902  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3194  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 86 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1559  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810667  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2441  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1246  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3691  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2731  DNA-binding protein  30.67 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989155  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1469  Cro/CI family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2106  hypothetical protein  36.36 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7321  transcriptional regulator, XRE family  32.91 
 
 		 77 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000062062  decreased coverage  0.00000000166173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 513 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  35.94 
 
 		 370 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6264  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0000184029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4563  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3948  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697178 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01700  Helix-turn-helix protein  33.8 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.935014  normal  0.201437 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  40.35 
 
 		 270 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  39.22 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0543  helix-turn-helix domain protein  36.36 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 497 aa  42.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1926  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.616703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5908  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.84632  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0538  XRE family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 202 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4046  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0970  hypothetical protein  43.18 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5660  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 490 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176576  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 110 aa  41.6  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0883  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 116 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.901297 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 79 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1266  XRE family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 127 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.119071 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 85 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 503 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 200 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  29.85 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1450  helix-turn-helix domain protein  31.34 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.847526  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  36.67 
 
 		 201 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 192 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2163  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 710 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  43.14 
 
 		 517 aa  40.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1361  EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)  44.74 
 
 		 516 aa  40.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419571  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  42.31 
 
 		 302 aa  40.8  0.007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0045  PbsX family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108741  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 163 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2648  transcriptional regulator, XRE family  46 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.552058  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 193 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1035  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>