42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3948 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3948  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 73 aa  147  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697178 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6264  XRE family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 188 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0000184029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2441  DNA-binding protein  42.25 
 
 		 80 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1246  DNA-binding protein  42.25 
 
 		 80 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1559  DNA-binding protein  42.25 
 
 		 80 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810667  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4563  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 80 aa  74.7  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0719  DNA-binding protein  40.85 
 
 		 80 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196932  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1707  DNA-binding protein  40.85 
 
 		 80 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0743  DNA-binding protein  40.85 
 
 		 80 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4916  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.366268  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  45.61 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1469  Cro/CI family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 84 aa  57  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0717  DNA-binding protein  32.39 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0622  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.39 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831827  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0903  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3550  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0545283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2106  hypothetical protein  42.86 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0902  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03892  DNA-binding protein  40.38 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7321  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000062062  decreased coverage  0.00000000166173 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1813  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.464134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2731  DNA-binding protein  28.17 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989155  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5654  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 78 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.279432  normal  0.298954 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0800  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0983  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.525138  normal  0.0218109 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0810  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 85 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5908  helix-turn-helix domain protein  36.62 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.84632  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1926  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.616703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3194  XRE family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3691  XRE family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3955  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2410  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 88 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000194776  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1909  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 107 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3970  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 85 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1324  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 85 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2018  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.97795  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1906  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.82 
 
 		 128 aa  40.4  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000000040825  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1022  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0590  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5489  helix-turn-helix domain-containing protein  41.07 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.332694 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3635  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.314503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  28.81 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>