40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1906 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1906  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  100 
 
 		 128 aa  259  6.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000000040825  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0424  transcriptional regulator, XRE family  41.13 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2376  helix-turn-helix domain protein  40.4 
 
 		 282 aa  74.7  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.683565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1597  XRE family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 282 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6363  hypothetical protein  38.2 
 
 		 283 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0272477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 282 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4643  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 273 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0706  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.57 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4415  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 213 aa  45.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0277  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 204 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.128046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4270  helix-turn-helix domain protein  47.83 
 
 		 290 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0039  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.514774  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0099  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0731  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.18 
 
 		 418 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00340964  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2430  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 276 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5954  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2734  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00297691  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3869  XRE family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 183 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3931  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 253 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0766  XRE family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 284 aa  41.2  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0766  helix-turn-helix domain protein  40.35 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 504 aa  41.2  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0746  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  34.57 
 
 		 306 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3261  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.957848  normal  0.179215 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0998  transcriptional regulator, XRE family  26.61 
 
 		 195 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69980  putative transcriptional regulator  35.21 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6075  putative transcriptional regulator  35.21 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 190 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3411  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 183 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 489 aa  40.4  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 505 aa  40.8  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3948  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 73 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 490 aa  40.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 208 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0249  XRE family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 135 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 208 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 208 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>