42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5489 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009339  Mflv_5489  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 124 aa  244  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.332694 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5523  helix-turn-helix domain-containing protein  55.24 
 
 		 118 aa  103  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0720631  hitchhiker  0.0000000329462 
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2429  helix-turn-helix domain-containing protein  47.06 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3625  helix-turn-helix domain protein  44.78 
 
 		 103 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8074  transcriptional regulator  37.36 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.725371  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  43.28 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  35.23 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0097  putative transcriptional regulator  39.19 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0986  helix-turn-helix domain protein  45.61 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0636  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0895  putative transcriptional regulator  36.76 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.652502  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5283  hypothetical protein  39.47 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.488524  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3687  helix-turn-helix domain protein  43.28 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2518  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.99787 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3798  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000456685  hitchhiker  0.000109219 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  46.94 
 
 		 263 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2214  hypothetical protein  37.5 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.351958 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3807  hypothetical protein  36.76 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2395  putative transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2396  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0010  DNA-binding protein  36 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.713803 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0024  DNA-binding protein  36 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3835  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 100 aa  43.5  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3535  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1801  DNA-binding transcriptional regulator HipB  36.92 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  34.83 
 
 		 94 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0807  helix-turn-helix domain-containing protein  41.07 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  40.48 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2882  XRE family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00173461  normal  0.866875 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 91 aa  40.8  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0665  XRE family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 103 aa  40.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3948  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 73 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697178 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1909  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12056  transcriptional regulator  36.96 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0647  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 97 aa  40  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.459505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>