108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1801 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1801  DNA-binding transcriptional regulator HipB  100 
 
 		 83 aa  172  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  51.35 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  50 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  51.35 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  50 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4613  helix-turn-helix domain protein  48.48 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.590277  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0367  XRE family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 93 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0365  helix-turn-helix domain-containing protein  45 
 
 		 93 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  45 
 
 		 93 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0306  transciptional regulator  46.05 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93162  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4032  helix-turn-helix domain protein  49.25 
 
 		 83 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.964235  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0496  XRE family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3847  helix-turn-helix domain-containing protein  47.76 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4245  helix-turn-helix domain protein  47.76 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2034  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.194194 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0567  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.102591  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0065  hypothetical protein  42.03 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003247  putative transcription regulator protein  34.29 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1915  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.799088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2442  XRE family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4519  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 168 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0338  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 171 aa  51.2  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  29.76 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0789  HipB domain-containing protein  35.59 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107176  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5634  XRE family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909222  normal  0.150315 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1592  HipB domain-containing protein  37.29 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3331  putative transcription regulator protein  34.33 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2003  HipB domain-containing protein  37.29 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2236  putative transcriptionl regulator HipB  37.29 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.74282  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2151  putative transcriptionl regulator HipB  37.29 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0681  putative transcriptionl regulator HipB  37.29 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0634  HipB domain-containing protein  37.29 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29949  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2577  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0918178  hitchhiker  0.000133769 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2611  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0796411  hitchhiker  0.0000000000000114 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3161  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5530  XRE family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0171722 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1447  putative transcription regulator protein  30.3 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  36.49 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2898  transcriptional regulator, XRE family  29.87 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2661  putative transcription regulator protein  30.77 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.574569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  42 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1459  helix-turn-helix domain protein  35.62 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2922  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.562834  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001517  predicted transcriptional regulator  32.31 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000562754  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1622  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 142 aa  43.5  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00320147  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3970  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4397  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0557  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  35.82 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2290  hypothetical protein  30 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0285  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.17528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3780  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6340  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 183 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2518  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.99787 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2377  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 183 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3038  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 183 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2991  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 183 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2985  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 183 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3011  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 183 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5958  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 134 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2901  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 183 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4902  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 84 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.173853  normal  0.0865423 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2176  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 97 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2426  hypothetical protein  30 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1565  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0821  XRE family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.323494  hitchhiker  0.000184498 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  46 
 
 		 432 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5489  helix-turn-helix domain-containing protein  36.92 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.332694 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3100  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000473627  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4784  transcriptional regulator, XRE family  35.19 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0510271 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4224  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1957  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 208 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.210401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1916  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193475  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  30.14 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3484  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 200 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0925  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 182 aa  41.2  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2038  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 230 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.547476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0944  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 189 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1365  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 173 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.927865 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0867  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  41.2  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0318952  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1443  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4469  helix-turn-helix domain-containing protein  30.99 
 
 		 209 aa  41.2  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4938  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 206 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4983  transcriptional regulator, XRE family  30.99 
 
 		 209 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0953387  normal  0.300371 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4933  transcriptional regulator, XRE family  30.99 
 
 		 209 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4967  transcriptional regulator, XRE family  30.99 
 
 		 218 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454469  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3701  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2884  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 181 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0819457  normal  0.480487 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2806  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 181 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2898  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 181 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4302  transcriptional regulator, XRE family  30.36 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.397769  normal  0.707115 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>