32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3535 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3535  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 103 aa  197  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3687  helix-turn-helix domain protein  94.17 
 
 		 103 aa  186  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3625  helix-turn-helix domain protein  94.17 
 
 		 103 aa  185  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  91.26 
 
 		 103 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0636  transcriptional regulator  50 
 
 		 127 aa  67  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8074  transcriptional regulator  44.93 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.725371  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0895  putative transcriptional regulator  39.71 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.652502  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3798  helix-turn-helix domain-containing protein  48.33 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000456685  hitchhiker  0.000109219 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2429  helix-turn-helix domain-containing protein  48.33 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2214  hypothetical protein  49.12 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.351958 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3807  hypothetical protein  41.1 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5283  hypothetical protein  43.48 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.488524  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0986  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 264 aa  47.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 264 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0097  putative transcriptional regulator  40.85 
 
 		 114 aa  47  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12056  transcriptional regulator  44.62 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6666  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384306  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1922  transcriptional regulator, XRE family  33 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189064  normal  0.0105553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0665  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1652  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000422118  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  44.64 
 
 		 263 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0010  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 99 aa  42.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.713803 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0024  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 99 aa  42.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5489  helix-turn-helix domain-containing protein  41.79 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.332694 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5523  helix-turn-helix domain-containing protein  42.37 
 
 		 118 aa  42  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0720631  hitchhiker  0.0000000329462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7019  putative transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0041  XRE family transcriptional regulator  46 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0512908  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0084  XRE family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 109 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2395  putative transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1909  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>