79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_B2805 on replicon NC_007615
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 123 aa  247  4e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3798  helix-turn-helix domain-containing protein  46.61 
 
 		 123 aa  97.4  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000456685  hitchhiker  0.000109219 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5283  hypothetical protein  41.67 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.488524  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0636  transcriptional regulator  40.19 
 
 		 127 aa  86.7  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0097  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0986  helix-turn-helix domain protein  51.28 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2214  hypothetical protein  52.94 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.351958 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2429  helix-turn-helix domain-containing protein  38.75 
 
 		 103 aa  62  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0024  DNA-binding protein  45.59 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0010  DNA-binding protein  45.59 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.713803 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1457  putative transcriptional regulator, XRE family  43.53 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0521049  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0895  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.652502  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0024  hypothetical protein  45 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000416515  hitchhiker  0.00176167 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2518  XRE family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.99787 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0665  XRE family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3687  helix-turn-helix domain protein  44.12 
 
 		 103 aa  57  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2396  XRE family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3625  helix-turn-helix domain protein  44.12 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3835  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1922  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189064  normal  0.0105553 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1380  transcription regulator  32.99 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4345  transcriptional regulator, XRE family  41.33 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0197394  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8074  transcriptional regulator  38.96 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.725371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7019  putative transcriptional regulator, XRE family  43.59 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3535  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 264 aa  54.7  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 264 aa  54.7  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  45.76 
 
 		 103 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0870  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  47.37 
 
 		 263 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2395  putative transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5523  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0720631  hitchhiker  0.0000000329462 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3807  hypothetical protein  34.62 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2882  XRE family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00173461  normal  0.866875 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12056  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8556  putative transcriptional regulator, XRE family  38.96 
 
 		 106 aa  48.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  37.33 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0084  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1480  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.86 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.695506 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2672  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.474837  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  39.47 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5489  helix-turn-helix domain-containing protein  29.25 
 
 		 124 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.332694 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0834  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.259279 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0717  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0220217 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1909  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  32.18 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1724  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0117  putative DNA-binding protein  37.66 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  34.12 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0593  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0244812  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0601  transcriptional regulator, XRE family  38.36 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1932  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0381  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0773865 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3276  hypothetical protein  34.62 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7015  putative transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989255 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  35.82 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0807  helix-turn-helix domain-containing protein  32.05 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  35.11 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  35.11 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1386  XRE family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2787  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6666  helix-turn-helix domain protein  36.07 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384306  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0039  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.514774  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0744  DNA-binding protein  37.21 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7321  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 77 aa  40.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000062062  decreased coverage  0.00000000166173 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  36.59 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2818  transcriptional regulator, XRE family  31.87 
 
 		 173 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0590  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  54.29 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0647  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 97 aa  40  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.459505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>