70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3276 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I3276  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0117  putative DNA-binding protein  81.9 
 
 		 105 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  60.78 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  60.78 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  60.78 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5139  XRE family transcriptional regulator  60.47 
 
 		 95 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3280  XRE family transcriptional regulator  61.63 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.843876 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  60.53 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4157  XRE family transcriptional regulator  58.14 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.555179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0827  XRE family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 116 aa  84.3  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.551431  normal  0.496549 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0593  transcriptional regulator, XRE family  45.36 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0244812  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2419  transcriptional regulator, XRE family  43.3 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0834  XRE family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 107 aa  83.6  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.259279 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1829  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0601  transcriptional regulator, XRE family  44.33 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  48.75 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0084  XRE family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0723  transcriptional regulator, XRE family  48.94 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000669172 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  54.22 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0773865 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1724  transcriptional regulator, XRE family  43.3 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2787  transcriptional regulator, XRE family  55.42 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0870  transcriptional regulator, XRE family  47.56 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0807  helix-turn-helix domain-containing protein  43.01 
 
 		 94 aa  67  0.00000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  44.71 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  38.04 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3411  XRE family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  46.51 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  46.51 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 94 aa  60.1  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0744  DNA-binding protein  45.88 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3174  XRE family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00826056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1888  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1879  DNA-binding protein  39.02 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0311  transcriptional regulator  39.02 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0010  DNA-binding protein  43.66 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.235299  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2529  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000784971  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 100 aa  50.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  34.48 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0099  DNA-binding protein  38.96 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  32.53 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1462  XRE family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0039  DNA-binding protein  33 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.514774  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  33.68 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2651  transcriptional regulator, XRE family  52 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1927  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2220  DNA-binding protein  30 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0402427  normal  0.0285701 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1817  DNA-binding protein  30 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.252724  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1138  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  normal  0.249316 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3256  helix-turn-helix domain-containing protein  43.33 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2226  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.782341  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  34.83 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4582  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.752323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  46.3 
 
 		 263 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4397  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3970  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0647  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  60 
 
 		 513 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0590  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  40.35 
 
 		 517 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>