32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1380 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1380  transcription regulator  100 
 
 		 100 aa  200  5e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2518  XRE family transcriptional regulator  52 
 
 		 100 aa  114  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.99787 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2396  XRE family transcriptional regulator  51 
 
 		 100 aa  113  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0010  DNA-binding protein  50 
 
 		 99 aa  110  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.713803 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0024  DNA-binding protein  50 
 
 		 99 aa  110  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0665  XRE family transcriptional regulator  38 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3835  XRE family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 100 aa  84.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0024  hypothetical protein  38.78 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000416515  hitchhiker  0.00176167 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1457  putative transcriptional regulator, XRE family  38 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0521049  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2672  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.474837  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3798  helix-turn-helix domain-containing protein  40.22 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000456685  hitchhiker  0.000109219 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8074  transcriptional regulator  35 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.725371  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3807  hypothetical protein  35 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2429  helix-turn-helix domain-containing protein  34.41 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2214  hypothetical protein  49.15 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.351958 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0895  putative transcriptional regulator  32.95 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.652502  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0097  putative transcriptional regulator  33.7 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0636  transcriptional regulator  33.7 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5283  hypothetical protein  32.95 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.488524  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1932  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  29.11 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0986  helix-turn-helix domain protein  32.61 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 264 aa  44.3  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 264 aa  44.3  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  25.97 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  32.39 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3687  helix-turn-helix domain protein  32.39 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12056  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3625  helix-turn-helix domain protein  32.81 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>