38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_0097 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_0097  putative transcriptional regulator  100 
 
 
114 aa  227  3e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5283  hypothetical protein  50.94 
 
 
131 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.488524  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0636  transcriptional regulator  48.62 
 
 
127 aa  97.8  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0986  helix-turn-helix domain protein  50 
 
 
124 aa  84  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85534  normal 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2429  helix-turn-helix domain-containing protein  44.57 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3798  helix-turn-helix domain-containing protein  39.62 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000456685  hitchhiker  0.000109219 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3807  hypothetical protein  42.11 
 
 
100 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0895  putative transcriptional regulator  44.59 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.652502  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8074  transcriptional regulator  37.63 
 
 
95 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.725371  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2214  hypothetical protein  43.24 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.351958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  47.89 
 
 
263 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0024  DNA-binding protein  37.5 
 
 
99 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0010  DNA-binding protein  37.5 
 
 
99 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.713803 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1380  transcription regulator  33.7 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2396  XRE family transcriptional regulator  32.61 
 
 
100 aa  52  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2518  XRE family transcriptional regulator  31.52 
 
 
100 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.99787 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5523  helix-turn-helix domain-containing protein  45.61 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0720631  hitchhiker  0.0000000329462 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3625  helix-turn-helix domain protein  42.25 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5489  helix-turn-helix domain-containing protein  39.19 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.332694 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  42.25 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13205  transcriptional regulator  44.44 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000994764  normal  0.452707 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3687  helix-turn-helix domain protein  42.25 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1480  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  46.94 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.695506 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  32.39 
 
 
264 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  32.39 
 
 
264 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0024  hypothetical protein  35.48 
 
 
100 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000416515  hitchhiker  0.00176167 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3535  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 
103 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2395  putative transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7015  putative transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00989255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  34.09 
 
 
101 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8556  putative transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0665  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 
100 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2672  XRE family transcriptional regulator  27.96 
 
 
100 aa  41.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.474837  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0084  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 
109 aa  41.2  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1386  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 
101 aa  40.4  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1457  putative transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0521049  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12056  transcriptional regulator  32.29 
 
 
101 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>