93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1386 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1386  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 101 aa  206  8e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1858  XRE family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 100 aa  115  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2425  transcriptional regulator  51.06 
 
 		 99 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  49.41 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0381  XRE family transcriptional regulator  55.71 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  51.43 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1916  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193475  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1932  transcriptional regulator, XRE family  48.61 
 
 		 91 aa  67  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12438  transcriptional regulator, XRE family protein  32.61 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0697698  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1909  XRE family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1719  transcriptional regulator, XRE family  36.96 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.134789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0647  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0590  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0914  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 503 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13300  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  42.62 
 
 		 509 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.801467  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 513 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  44.9 
 
 		 513 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1361  EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)  40.82 
 
 		 516 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419571  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  46.94 
 
 		 508 aa  48.1  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 204 aa  47.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  41.38 
 
 		 517 aa  47  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1442  transcriptional regulator, XRE family  37.36 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0063  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0870  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  48.98 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1911  putative transcription regulator protein  35.82 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0010  DNA-binding protein  38.98 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.235299  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0665  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4245  helix-turn-helix domain protein  37.88 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1046  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2661  putative transcription regulator protein  36.51 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.574569 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1915  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.799088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0084  XRE family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0140  helix-turn-helix domain protein  30.65 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.7168 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0490  Fis family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1336  helix-turn-helix domain-containing protein  30.61 
 
 		 225 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4897  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3477  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 737 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552103  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4562  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00197637  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4472  hypothetical protein  36 
 
 		 464 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  34.38 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3349  XRE family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1661  helix-turn-helix domain-containing protein  30.61 
 
 		 225 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0888  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 179 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  36.76 
 
 		 465 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  38.33 
 
 		 94 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0551  transcriptional regulator, XRE family  43.18 
 
 		 210 aa  42  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.401249  hitchhiker  0.0000933135 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 194 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1879  DNA-binding protein  29.59 
 
 		 108 aa  42  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0311  transcriptional regulator  29.59 
 
 		 108 aa  42  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0685  Cro/CI family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 179 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  38.33 
 
 		 94 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0898  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 179 aa  41.2  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0986  helix-turn-helix domain protein  42.37 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0744  DNA-binding protein  35.71 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  35.42 
 
 		 472 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2395  putative transcriptional regulator, XRE family  29 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1125  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  42 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1039  XRE family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 264 aa  41.2  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000101655  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1896  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 512 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2651  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 176 aa  41.2  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7019  putative transcriptional regulator, XRE family  29.58 
 
 		 109 aa  41.2  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 225 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1190  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  37.29 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0097  putative transcriptional regulator  46.3 
 
 		 114 aa  40.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1519  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0937641 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3914  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  37.93 
 
 		 488 aa  40.8  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  31.51 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4004  transcriptional regulator, XRE family  44 
 
 		 181 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4302  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.397769  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3687  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 79 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1462  transcriptional regulator, XRE family  43.59 
 
 		 114 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  29.73 
 
 		 94 aa  40  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>