95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1462 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1462  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 114 aa  226  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2752  XRE family transcriptional regulator  69.44 
 
 		 113 aa  152  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0650  transcriptional regulator, XRE family  33.64 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1263  XRE family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.197496  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1900  transcriptional regulator, XRE family  34.91 
 
 		 104 aa  57  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.43236e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0826  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000131659  unclonable  0.000000470251 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2662  XRE family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 128 aa  52.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2614  XRE family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 127 aa  52.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.105443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2854  XRE family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770075  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0908  XRE family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 497 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  63.89 
 
 		 252 aa  47  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0455  helix-turn-helix domain-containing protein  40.62 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.846585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3153  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 290 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3171  XRE family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  35.11 
 
 		 206 aa  45.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5634  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909222  normal  0.150315 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3859  hypothetical protein  38.1 
 
 		 233 aa  44.3  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0315  helix-turn-helix domain-containing protein  31.48 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138688  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5312  XRE family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0407  transcriptional regulator  37.66 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1396  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  45.24 
 
 		 484 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0683  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 239 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1422  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 652 aa  43.5  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 500 aa  43.5  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3281  transcriptional regulator, XRE family  30.21 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.871806 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1858  XRE family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_277  DNA-binding protein  31.48 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000765574  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  37.88 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  37.88 
 
 		 72 aa  42.7  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5660  XRE family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 490 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176576  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  30.39 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  31.4 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5920  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0336  DNA-binding protein, putative  31.48 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00628261  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 490 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  29.03 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  29.03 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  32.53 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  35.48 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2395  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 239 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1500  hypothetical protein  30.38 
 
 		 469 aa  41.6  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983319  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0669  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 75 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  38.1 
 
 		 264 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6563  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  32.31 
 
 		 217 aa  41.2  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06790  hypothetical protein  34.92 
 
 		 187 aa  41.2  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  32.31 
 
 		 217 aa  41.2  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  48.65 
 
 		 83 aa  41.2  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  32.31 
 
 		 217 aa  41.2  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0079  DNA-binding protein  30.14 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1848  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4808  hypothetical protein  42.86 
 
 		 223 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.463187 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1349  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3477  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 737 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552103  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0488  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.592265  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 490 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0038  XRE family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2873  hypothetical protein  29.03 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305653  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4271  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.313399 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2818  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 173 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4589  helix-turn-helix domain protein  37.31 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 74 aa  40.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4609  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.273253  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 220 aa  40.4  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.1 
 
 		 481 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1386  XRE family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0621  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 161 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  34.67 
 
 		 488 aa  40.4  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 223 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0577  XRE family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0298135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  28.89 
 
 		 374 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2372  transcriptional regulator, XRE family  32.91 
 
 		 173 aa  40  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 67 aa  40  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1750  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 129 aa  40  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00805015  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3482  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 104 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.411907  normal  0.584278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>