39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0140 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0140  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 87 aa  174  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.7168 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30630  transcription regulator protein  58.23 
 
 		 122 aa  95.9  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.635425  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1911  putative transcription regulator protein  51.61 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5392  helix-turn-helix domain-containing protein  48.78 
 
 		 183 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471231  normal  0.0187132 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2661  putative transcription regulator protein  55.07 
 
 		 111 aa  84  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.574569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2282  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.545722  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0291  helix-turn-helix domain protein  43.08 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0830  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 88 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.0000289664  hitchhiker  0.0000066158 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1918  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0543598  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1067  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.753603 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1251  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6539  XRE family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6581  XRE family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6254  helix-turn-helix domain-containing protein  43.84 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.853292 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0510  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2260  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5937  transcriptional regulator, XRE family  48.15 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496478  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0283  XRE family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3420  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.964582 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1776  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0912116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1386  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1856  hypothetical protein  36.36 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2290  hypothetical protein  32.81 
 
 		 74 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1196  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 75 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.151247 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 		 140 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2898  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0415  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187389  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4233  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 231 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4541  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3755  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 189 aa  40.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 191 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 191 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 191 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 205 aa  40.4  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1519  transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0937641 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4217  helix-turn-helix domain-containing protein  26.15 
 
 		 69 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  48.65 
 
 		 503 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>