44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5392 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5392  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 183 aa  349  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471231  normal  0.0187132 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2661  putative transcription regulator protein  68.89 
 
 		 111 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.574569 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30630  transcription regulator protein  64.1 
 
 		 122 aa  108  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.635425  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1911  putative transcription regulator protein  53.41 
 
 		 112 aa  101  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0140  helix-turn-helix domain protein  48.78 
 
 		 87 aa  85.5  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.7168 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0830  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.0000289664  hitchhiker  0.0000066158 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1918  transcriptional regulator, XRE family  41.33 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0543598  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0291  helix-turn-helix domain protein  42.19 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0510  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1856  hypothetical protein  36 
 
 		 141 aa  54.3  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1776  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 79 aa  52  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0912116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2282  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 95 aa  52  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.545722  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0283  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 99 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0376  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 82 aa  47.8  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000453716 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5937  transcriptional regulator, XRE family  39.24 
 
 		 108 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496478  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2711  hypothetical protein  40.62 
 
 		 94 aa  46.2  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4570  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 82 aa  45.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1916  hypothetical protein  37.93 
 
 		 93 aa  45.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 126 aa  45.1  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0705  Cro/CI family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 97 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0649  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 78 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0677  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 78 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0168  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 86 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6539  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 94 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6581  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 94 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0557  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 78 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.948289 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3396  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 97 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158475 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0669  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 78 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1251  XRE family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 94 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4541  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 108 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6254  helix-turn-helix domain-containing protein  37.33 
 
 		 94 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.853292 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 191 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0326  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 112 aa  42.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 191 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 191 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1067  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 86 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.753603 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2930  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 112 aa  42  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.372042  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3656  transcriptional regulator, XRE family protein  37.5 
 
 		 78 aa  42  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03585  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 206 aa  41.6  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5997  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.33 
 
 		 104 aa  41.6  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0190  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 		 112 aa  41.6  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 106 aa  41.2  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  28.38 
 
 		 88 aa  41.2  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0180  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 		 112 aa  41.2  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0484456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>