45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03585 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03585  transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  417  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1225  transcriptional regulator, XRE family  49.25 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2260  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 72 aa  57  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1136  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1757  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 84 aa  53.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.489894  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4412  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 183 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0919942  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0510  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 89 aa  52  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2898  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 83 aa  51.6  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08690  Helix-turn-helix protein  40.54 
 
 		 87 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176489 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2711  hypothetical protein  39.06 
 
 		 94 aa  51.2  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1776  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 79 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0912116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5678  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 90 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.669501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0094  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 85 aa  49.3  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.850445  normal  0.0181777 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0830  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 88 aa  48.9  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.0000289664  hitchhiker  0.0000066158 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2883  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 71 aa  48.5  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 83 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02550  predicted transcriptional regulator  47.06 
 
 		 67 aa  47.8  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.596606  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2426  hypothetical protein  32.39 
 
 		 75 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1196  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 75 aa  45.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.151247 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0291  helix-turn-helix domain protein  37.1 
 
 		 92 aa  45.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3371  helix-turn-helix domain-containing protein  38.71 
 
 		 88 aa  45.1  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5848  transcriptional regulator, XRE family  54.05 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1274  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 91 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4154  hypothetical protein  35.14 
 
 		 82 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5258  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 83 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5392  helix-turn-helix domain-containing protein  32.31 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471231  normal  0.0187132 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13300  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  40.3 
 
 		 509 aa  43.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.801467  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2290  hypothetical protein  35.09 
 
 		 74 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1618  putative DNA-binding protein  38.46 
 
 		 84 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2282  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 95 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.545722  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1247  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 111 aa  42.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5231  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 543 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03640  predicted transcriptional regulator  38.71 
 
 		 98 aa  42.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  32.76 
 
 		 126 aa  42  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7086  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 119 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.633613  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6254  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 94 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.853292 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 66 aa  41.6  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  28.12 
 
 		 88 aa  41.6  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  28.12 
 
 		 88 aa  41.6  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  28.12 
 
 		 88 aa  41.6  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  28.12 
 
 		 88 aa  41.6  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6539  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 94 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  34.21 
 
 		 79 aa  41.2  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1896  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 		 512 aa  41.2  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>