25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5258 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5258  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 83 aa  165  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20520  DNA binding protein, XRE family  58.11 
 
 		 76 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  46.03 
 
 		 508 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2898  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15700  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  34.33 
 
 		 507 aa  47.4  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.645755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2442  XRE family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  35.62 
 
 		 517 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 513 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03585  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 206 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4849  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 216 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0377  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3687  transcriptional regulator, XRE family  42.25 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5665  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4072  helix-turn-helix domain protein  39.44 
 
 		 380 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1225  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08690  Helix-turn-helix protein  37.68 
 
 		 87 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176489 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1344  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 258 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.388374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 169 aa  41.2  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0950  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0677  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 276 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244102  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36660  predicted transcriptional regulator with C-terminal CBS domains  40.38 
 
 		 293 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0372485  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0821  XRE family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.323494  hitchhiker  0.000184498 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>