22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08690 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_08690  Helix-turn-helix protein  100 
 
 		 87 aa  165  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176489 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2883  transcriptional regulator, XRE family  53.33 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03585  transcriptional regulator  40.54 
 
 		 206 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2711  hypothetical protein  40.68 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5678  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.669501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03640  predicted transcriptional regulator  35.62 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1274  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.329441  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1225  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  35.53 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  35.53 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  35.53 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5258  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 83 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0554  prophage LambdaSa1, Cro/CI family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  60.53 
 
 		 230 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 333 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 333 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  44 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1757  transcriptional regulator, XRE family  36.9 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.489894  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  39.66 
 
 		 270 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  37.7 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  30.51 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>