More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0884 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  100 
 
 		 217 aa  433  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  100 
 
 		 217 aa  433  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  100 
 
 		 217 aa  433  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  32.08 
 
 		 196 aa  97.1  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0873  DNA-binding protein, putative  29.44 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0791  XRE family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  28.84 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3510  LexA repressor  32.81 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  28.77 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  33.07 
 
 		 207 aa  72  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  29.66 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  32.81 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  34.75 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1234  putative prophage repressor  34.51 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000530915  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  27.97 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  27.97 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3956  LexA repressor  35.2 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  0.995266 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  27.97 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  27.97 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  27.97 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2221  LexA repressor  35.48 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  27.97 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  27.97 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  27.97 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  27.97 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2441  LexA repressor  35.2 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628301  normal  0.115914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1232  LexA repressor  30.65 
 
 		 250 aa  68.2  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  0.0166325 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  30.5 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1808  transcriptional repressor, LexA family  27.18 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.06 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.54 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0020  SOS-response transcriptional repressor, LexA  27.96 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000309012  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.58 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  32.8 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  32.8 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  27.97 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  32.8 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1054  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.33 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.675228 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1183  putative prophage repressor  37.1 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355534  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  31.86 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1741  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.42 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1255  transcriptional regulator, XRE family  25.31 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0691404  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1468  LexA repressor  28.57 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.097089  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.45 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3974  LexA repressor  30.95 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1204  LexA repressor  31.36 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000092857  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  29.6 
 
 		 238 aa  64.7  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0970  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3151  Repressor lexA  32.26 
 
 		 154 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.662921  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  30.4 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  29.49 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23040  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.08 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.620289  normal  0.0692962 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.92 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  26.27 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  29.55 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  32.26 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0891  peptidase S24 and S26 domain protein  32 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.352562  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  26.36 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1814  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.8 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1470  LexA repressor  27.34 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000034906 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.08 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0677  LexA repressor  32.2 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000451027  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  31.25 
 
 		 275 aa  62  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  34.58 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0151  LexA family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1019  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0426259 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.06 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1366  putative prophage repressor  27.19 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.291481  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  31.71 
 
 		 153 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  28.15 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  29.03 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1566  transcriptional repressor, LexA family  30.89 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000959525 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  29.03 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  28.67 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3979  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.4 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.712673  normal  0.0708135 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  29.45 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0108  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.75 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.33 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.33 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  30.51 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  33.33 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.52 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  26.94 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1384  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.85 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0425171  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17230  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.45 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.302677 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  30.51 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  27.23 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  30.22 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_002936  DET1640  LexA repressor  34.85 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0943463  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  25.36 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1522  LexA repressor  34.85 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0737181  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  28.8 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.09 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.37 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  30.71 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.11 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2951  putative prophage repressor  31.09 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>