More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0710 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  100 
 
 		 245 aa  509  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0891  peptidase S24 and S26 domain protein  31.82 
 
 		 338 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.352562  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  34.18 
 
 		 196 aa  97.1  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0874  helix-turn-helix domain-containing protein  43.75 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000967944  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  28.84 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  28.84 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  28.84 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 101 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1183  putative prophage repressor  28.66 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355534  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0145  LexA repressor  42.7 
 
 		 253 aa  72  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0813581  normal  0.028375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3974  LexA repressor  37.01 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1054  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.5 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.675228 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3216  LexA repressor  42.7 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  34.88 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.02 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  37.5 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0891  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 106 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2883  LexA repressor  42.7 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6716  LexA repressor  37.08 
 
 		 239 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.66 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7466  LexA repressor  37.08 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0525959  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10620  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.96 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.445804  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5148  LexA repressor  35.96 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4683  LexA repressor  35.96 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  37.5 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1398  LexA repressor  39.33 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0394498  hitchhiker  0.000716176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2020  LexA repressor  37.08 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.48 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2839  LexA repressor  40.45 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  40.45 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  41.57 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5225  LexA repressor  34.83 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  37.1 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4371  LexA repressor  35.96 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1803  LexA repressor  36.36 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00193546  normal  0.136628 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  33.06 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  27.01 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3249  LexA repressor  39.33 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  33.07 
 
 		 168 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  31.08 
 
 		 168 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  33.07 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  30.56 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2045  LexA repressor  34.83 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.1 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  35.94 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  40.45 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  33.33 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  39.33 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0572  repressor LexA  34.68 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0263209 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17230  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.48 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.302677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  35.71 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1678  LexA repressor  37.08 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.29341 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.77 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  31.45 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  31.45 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3178  LexA repressor  35.96 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  31.45 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0832  LexA repressor  38.2 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0630209  hitchhiker  0.00461064 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  31.45 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_004310  BR1144  LexA repressor  31.2 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  30.65 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1898  LexA repressor  37.5 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  42.17 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  29.86 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07330  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.03 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.140562  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1104  LexA repressor  31.2 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  29.86 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  32.03 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2454  LexA repressor  38.2 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212024  normal  0.397716 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1642  LexA repressor  33.71 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217888  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.4 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  30.22 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0887  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  31.45 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  35.96 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1997  LexA repressor  34.09 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0707  LexA repressor  34.09 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.265887 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1135  LexA repressor  35.23 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.725643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  30.56 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.96 
 
 		 132 aa  61.2  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  31.45 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0180  LexA repressor  34.45 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08540  predicted transcriptional regulator  45 
 
 		 76 aa  60.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102347 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0020  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.15 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000309012  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0167  LexA repressor  32.26 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.139348  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3094  LexA repressor  32.95 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1419  LexA repressor  38.2 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4415  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  25.36 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1353  LexA repressor  34.83 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  35.48 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  34.68 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1566  transcriptional repressor, LexA family  35.77 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000959525 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.86 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  34.09 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>