More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1912 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  100 
 
 		 196 aa  383  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  47.54 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1808  transcriptional repressor, LexA family  39.13 
 
 		 236 aa  107  9.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  46.72 
 
 		 261 aa  107  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 258 aa  106  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  45.24 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23040  SOS-response transcriptional repressor, LexA  45.83 
 
 		 258 aa  105  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.620289  normal  0.0692962 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  45.9 
 
 		 263 aa  105  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  43.75 
 
 		 275 aa  105  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.47 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2221  LexA repressor  45.08 
 
 		 233 aa  104  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110096  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3956  LexA repressor  45.9 
 
 		 232 aa  104  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  0.995266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.75 
 
 		 235 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2441  LexA repressor  45.9 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628301  normal  0.115914 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.19 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3979  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.62 
 
 		 252 aa  101  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.712673  normal  0.0708135 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  43.44 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  43.44 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  43.44 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.8 
 
 		 229 aa  99.8  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.64 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  44.26 
 
 		 217 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.13 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  48 
 
 		 196 aa  99.8  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  38.76 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.73 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1506  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.21 
 
 		 244 aa  98.6  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.03098  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  39.1 
 
 		 230 aa  98.2  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3510  LexA repressor  42.52 
 
 		 256 aa  98.2  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  42.62 
 
 		 236 aa  98.6  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2433  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.62 
 
 		 219 aa  98.2  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342507  normal  0.324912 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1566  transcriptional repressor, LexA family  43.33 
 
 		 252 aa  98.2  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000959525 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.62 
 
 		 227 aa  98.2  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.67 
 
 		 243 aa  98.2  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.53 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.99 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1232  LexA repressor  42.62 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  0.0166325 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  44.55 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  32.08 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  32.08 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  32.08 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17230  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.8 
 
 		 233 aa  96.3  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.302677 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  34.18 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  40.87 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.12 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2152  peptidase S24, LexA repressor  42.19 
 
 		 252 aa  94.7  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0120342  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.51 
 
 		 200 aa  94.4  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1572  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.71 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.51 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  38.1 
 
 		 222 aa  92.8  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  37.74 
 
 		 203 aa  91.7  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.71 
 
 		 197 aa  91.3  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  42.11 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 197 aa  89.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  42.86 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10620  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.53 
 
 		 234 aa  90.1  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.445804  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  40.5 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  40.5 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.16 
 
 		 201 aa  89  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.16 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3974  LexA repressor  42.19 
 
 		 219 aa  88.6  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07330  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.36 
 
 		 238 aa  88.6  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.140562  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1470  LexA repressor  38.33 
 
 		 249 aa  88.6  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000034906 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1468  LexA repressor  36.51 
 
 		 288 aa  88.6  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.097089  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0108  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35 
 
 		 209 aa  88.2  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  35.82 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1234  putative prophage repressor  36.59 
 
 		 153 aa  87  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000530915  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  35.29 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0677  LexA repressor  38.52 
 
 		 208 aa  87  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000451027  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2134  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.11 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2117  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.84 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.357832  hitchhiker  0.000000326173 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.84 
 
 		 231 aa  87.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  34.56 
 
 		 206 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  34.56 
 
 		 206 aa  86.3  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  34.56 
 
 		 206 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  34.56 
 
 		 206 aa  86.3  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.84 
 
 		 228 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0237  LexA repressor  37.7 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  34.56 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  34.56 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3151  Repressor lexA  40.44 
 
 		 154 aa  86.3  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.662921  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  36.3 
 
 		 207 aa  85.9  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3481  LexA repressor  31.66 
 
 		 207 aa  85.9  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  40.5 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0770  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.38 
 
 		 217 aa  85.5  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.953907  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  34.56 
 
 		 269 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  40 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  34.56 
 
 		 269 aa  85.1  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0501  transcriptional repressor, LexA family  39.34 
 
 		 249 aa  85.1  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.862173  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1918  LexA repressor  31.55 
 
 		 234 aa  85.1  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  34.69 
 
 		 232 aa  84.7  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  32.35 
 
 		 230 aa  84.3  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3515  LexA repressor  30.65 
 
 		 205 aa  84.3  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  34.56 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0167  LexA repressor  37.4 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.139348  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  35.16 
 
 		 819 aa  84.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0518  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.02 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  32.23 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0427  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.53 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783758  normal  0.159781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>