250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2471 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  100 
 
 		 216 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  39.07 
 
 		 216 aa  154  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  39.07 
 
 		 216 aa  154  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  37.21 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  34.56 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  35.32 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  36.57 
 
 		 218 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  35.84 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  35.84 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  35.35 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 204 aa  118  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  33.18 
 
 		 221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  36.07 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  30.36 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  32.84 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  33.79 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  34.25 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  33.18 
 
 		 215 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  31.92 
 
 		 237 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  31.02 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  31.9 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  32.84 
 
 		 243 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 228 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  30 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  29.23 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4010  repressor protein cI  31.63 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  31.02 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  29.41 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0617  hypothetical protein  59.68 
 
 		 71 aa  82  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  hitchhiker  0.00000289495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  34.65 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  45.65 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4068  Cro/CI family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0144241  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1773  putative prophage repressor  27.44 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000495428  hitchhiker  0.00108243 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  29.29 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1808  XRE family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630846  normal  0.212121 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2713  transcriptional regulator, XRE family  29.63 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  26.83 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  28.32 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1772  putative prophage repressor  29.09 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000601077  decreased coverage  0.000377038 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  27.81 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1019  XRE family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0426259 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  29 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3666  XRE family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100264  decreased coverage  0.0000000000010366 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  29.82 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  26.83 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.58 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  33.58 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.4 
 
 		 132 aa  61.2  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2211  putative repressor protein encoded within prophage CP-933O  25.7 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000372098  hitchhiker  7.21375e-19 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  23.89 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1255  transcriptional regulator, XRE family  26.05 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0691404  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  28.44 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  25.36 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  25.36 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  25.36 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  23.45 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  31.58 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  27.54 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  31.2 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2172  hypothetical protein  31.43 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  28.02 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  27.12 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  29.25 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  38.98 
 
 		 270 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  32.52 
 
 		 150 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.62 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  35.14 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  32.52 
 
 		 238 aa  52.8  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2605  peptidase S24/S26 domain-containing protein  28.68 
 
 		 140 aa  52.8  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  35.14 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  31.45 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  43.55 
 
 		 244 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  25.23 
 
 		 264 aa  52.4  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  35.14 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  33.6 
 
 		 138 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0191  hypothetical protein  25.69 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2805  transcriptional repressor, LexA family  33.78 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000318976  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  39.33 
 
 		 153 aa  51.6  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1234  putative prophage repressor  28.85 
 
 		 153 aa  51.6  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000530915  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  32.81 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  25.69 
 
 		 264 aa  51.6  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.87 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  30.89 
 
 		 139 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  33.6 
 
 		 138 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  31.21 
 
 		 143 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  24.06 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  23.33 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  33.6 
 
 		 138 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  40.32 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  38.71 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1673  putative phage repressor  24.71 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.219867  normal  0.134588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>