More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1234 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1234  putative prophage repressor  100 
 
 		 153 aa  310  3.9999999999999997e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000530915  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3151  Repressor lexA  55.63 
 
 		 154 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.662921  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0696  putative prophage repressor  51.97 
 
 		 157 aa  161  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00336277  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1002  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.87 
 
 		 215 aa  111  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  46.72 
 
 		 206 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  44.93 
 
 		 222 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0151  LexA family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 214 aa  105  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0427  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.33 
 
 		 243 aa  103  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783758  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3234  SOS-response transcriptional repressor, LexA  46.15 
 
 		 216 aa  102  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168509 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.86 
 
 		 207 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  41.67 
 
 		 210 aa  100  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  47.15 
 
 		 204 aa  100  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  46.03 
 
 		 213 aa  99.8  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  42.86 
 
 		 202 aa  97.4  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1207  transcriptional repressor, LexA family  41.67 
 
 		 210 aa  96.7  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325213  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.86 
 
 		 215 aa  96.7  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.27 
 
 		 214 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1640  LexA repressor  39.1 
 
 		 212 aa  95.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0943463  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1384  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.06 
 
 		 214 aa  95.1  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0425171  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1522  LexA repressor  39.1 
 
 		 214 aa  95.5  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0737181  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0677  LexA repressor  40.98 
 
 		 208 aa  94.7  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000451027  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  41.13 
 
 		 202 aa  94.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  35.62 
 
 		 206 aa  94.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.32 
 
 		 197 aa  94.7  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.55 
 
 		 196 aa  94.4  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  42.06 
 
 		 207 aa  94.4  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  41.13 
 
 		 204 aa  94  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 204 aa  93.6  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  35.62 
 
 		 223 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  35.62 
 
 		 206 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  35.62 
 
 		 269 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  35.62 
 
 		 206 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  35.62 
 
 		 269 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  35.62 
 
 		 206 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  35.62 
 
 		 206 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 197 aa  93.6  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  35.62 
 
 		 223 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  35.62 
 
 		 223 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2243  LexA repressor  43.14 
 
 		 198 aa  92.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.56 
 
 		 212 aa  91.7  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0770  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.41 
 
 		 217 aa  90.5  7e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.953907  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0832  LexA repressor  37.6 
 
 		 227 aa  90.5  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0630209  hitchhiker  0.00461064 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2029  LexA repressor  37.6 
 
 		 234 aa  90.5  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  41.27 
 
 		 206 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.27 
 
 		 201 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.26 
 
 		 212 aa  89  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  40.48 
 
 		 207 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  40.48 
 
 		 207 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1071  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.82 
 
 		 218 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.65 
 
 		 222 aa  89.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.76 
 
 		 231 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  41.27 
 
 		 207 aa  88.2  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.67 
 
 		 205 aa  88.2  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  40 
 
 		 203 aa  88.6  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  40 
 
 		 203 aa  88.2  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  39.23 
 
 		 204 aa  88.6  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3094  LexA repressor  38.24 
 
 		 228 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0145  LexA repressor  37.98 
 
 		 253 aa  88.2  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0813581  normal  0.028375 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0501  transcriptional repressor, LexA family  36.07 
 
 		 249 aa  88.2  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.862173  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1898  LexA repressor  38.71 
 
 		 251 aa  88.2  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2134  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.25 
 
 		 206 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  40.32 
 
 		 233 aa  87.8  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  39.68 
 
 		 230 aa  87.8  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  36.59 
 
 		 196 aa  87  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  38.71 
 
 		 233 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2839  LexA repressor  39.52 
 
 		 235 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0518  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.33 
 
 		 258 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  37.21 
 
 		 230 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.21 
 
 		 229 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3216  LexA repressor  38.4 
 
 		 224 aa  84.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.21 
 
 		 228 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  37.1 
 
 		 232 aa  84.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 210 aa  84  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  40.32 
 
 		 201 aa  83.6  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3152  LexA repressor  37.01 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3249  LexA repressor  37.9 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.3 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  37.1 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1398  LexA repressor  37.9 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0394498  hitchhiker  0.000716176 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2520  LexA repressor  32.89 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0774546  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  40.77 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2454  LexA repressor  36.29 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212024  normal  0.397716 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0085  LexA repressor  35.61 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00110389  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0099  LexA repressor  36.5 
 
 		 211 aa  80.9  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  39.67 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2082  LexA repressor  36 
 
 		 231 aa  80.5  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.414888 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  40.16 
 
 		 207 aa  80.5  0.000000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  40 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1144  LexA repressor  38.71 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1475  LexA repressor  34.87 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.457406 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1419  LexA repressor  35.94 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1104  LexA repressor  38.71 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0192  SOS-response transcriptional repressor, LexA  46.07 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1803  LexA repressor  38.4 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00193546  normal  0.136628 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1997  LexA repressor  36.29 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0707  LexA repressor  36.29 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.265887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1814  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.26 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1353  LexA repressor  39.52 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  36.36 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5225  LexA repressor  36.29 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>