More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0696 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0696  putative prophage repressor  100 
 
 
157 aa  324  4.0000000000000003e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00336277  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3151  Repressor lexA  57.14 
 
 
154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.662921  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1234  putative prophage repressor  51.97 
 
 
153 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000530915  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  46.83 
 
 
206 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1384  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.36 
 
 
214 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0425171  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1522  LexA repressor  44.36 
 
 
214 aa  107  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0737181  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1640  LexA repressor  44.36 
 
 
212 aa  106  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0943463  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  42.02 
 
 
210 aa  101  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3234  SOS-response transcriptional repressor, LexA  45.38 
 
 
216 aa  100  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0168509 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  39.86 
 
 
202 aa  100  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  37.09 
 
 
223 aa  100  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  37.09 
 
 
206 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  37.09 
 
 
206 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  37.09 
 
 
223 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  37.09 
 
 
206 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  37.09 
 
 
223 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  37.09 
 
 
206 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  37.09 
 
 
269 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  37.09 
 
 
269 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  37.09 
 
 
206 aa  99.4  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  41.45 
 
 
222 aa  99.4  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2029  LexA repressor  41.13 
 
 
234 aa  99.4  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.06 
 
 
214 aa  99.4  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  37.5 
 
 
204 aa  99  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  38.82 
 
 
204 aa  97.8  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  36.18 
 
 
207 aa  97.4  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0832  LexA repressor  39.1 
 
 
227 aa  97.8  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0630209  hitchhiker  0.00461064 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0145  LexA repressor  43.09 
 
 
253 aa  97.1  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0813581  normal  0.028375 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  42.62 
 
 
210 aa  96.7  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  35.95 
 
 
207 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1002  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.75 
 
 
215 aa  95.9  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  35.95 
 
 
207 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0151  LexA family transcriptional regulator  41.86 
 
 
214 aa  95.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0677  LexA repressor  40.98 
 
 
208 aa  95.1  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000451027  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.06 
 
 
207 aa  94.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3216  LexA repressor  41.6 
 
 
224 aa  95.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1898  LexA repressor  37.59 
 
 
251 aa  94  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0770  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.94 
 
 
217 aa  94  7e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.953907  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.82 
 
 
204 aa  94  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0427  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.19 
 
 
243 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783758  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.84 
 
 
213 aa  93.2  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  34.21 
 
 
206 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  34.87 
 
 
207 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  37.42 
 
 
202 aa  92.8  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0501  transcriptional repressor, LexA family  39.34 
 
 
249 aa  92  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.862173  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.67 
 
 
231 aa  91.7  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2045  LexA repressor  37.98 
 
 
239 aa  91.3  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613355  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3094  LexA repressor  38.46 
 
 
228 aa  91.3  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  37.98 
 
 
203 aa  90.5  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0518  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.52 
 
 
258 aa  90.5  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  37.98 
 
 
203 aa  90.5  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  36.73 
 
 
201 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  39.53 
 
 
233 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1204  LexA repressor  38.89 
 
 
212 aa  89.7  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000092857  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2134  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.33 
 
 
206 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  37.88 
 
 
230 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.88 
 
 
229 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  39.84 
 
 
228 aa  89.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.88 
 
 
228 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1184  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.25 
 
 
199 aa  88.6  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0793  LexA repressor  41.94 
 
 
207 aa  88.6  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163757  hitchhiker  8.744270000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.03 
 
 
231 aa  88.6  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  34.01 
 
 
203 aa  87.8  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1144  LexA repressor  36.57 
 
 
240 aa  87.8  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1678  LexA repressor  35.97 
 
 
236 aa  87.8  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.29341 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  38.93 
 
 
234 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1104  LexA repressor  36.57 
 
 
240 aa  87.8  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2883  LexA repressor  41.46 
 
 
231 aa  87.4  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  37.98 
 
 
232 aa  87.4  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1398  LexA repressor  38.3 
 
 
232 aa  87.4  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0394498  hitchhiker  0.000716176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2839  LexA repressor  39.84 
 
 
235 aa  87  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1997  LexA repressor  36.69 
 
 
228 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1135  LexA repressor  37.8 
 
 
241 aa  86.7  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.725643  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.9 
 
 
200 aa  86.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0707  LexA repressor  36.69 
 
 
227 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.265887 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.51 
 
 
196 aa  85.9  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1419  LexA repressor  37.59 
 
 
237 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.8 
 
 
215 aa  85.9  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1642  LexA repressor  35.97 
 
 
236 aa  86.3  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217888  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.03 
 
 
222 aa  86.3  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0970  XRE family transcriptional regulator  36.64 
 
 
212 aa  85.1  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2454  LexA repressor  36.43 
 
 
237 aa  84.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212024  normal  0.397716 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  37.9 
 
 
233 aa  84.3  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1791  LexA repressor  36.43 
 
 
239 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117655  hitchhiker  0.00108094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  41.32 
 
 
204 aa  84  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  37.3 
 
 
230 aa  84  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0099  LexA repressor  38.19 
 
 
211 aa  84  8e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.29 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1598  LexA repressor  36.43 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313402  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  35.97 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.17 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0085  LexA repressor  37.5 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00110389  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2243  LexA repressor  38.24 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4371  LexA repressor  33.33 
 
 
237 aa  82  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1803  LexA repressor  37.1 
 
 
231 aa  82  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00193546  normal  0.136628 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2782  LexA repressor  35.29 
 
 
235 aa  81.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0386684  hitchhiker  0.000588647 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  35.48 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3249  LexA repressor  36.29 
 
 
236 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3074  Repressor lexA  34.07 
 
 
197 aa  80.9  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  35 
 
 
819 aa  80.5  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>