195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0817 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  100 
 
 		 205 aa  401  1e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  27.55 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  29.13 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  26.41 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  27.71 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  28.07 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1743  putative phage repressor  29.44 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  26.75 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  29.21 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  29.13 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1409  putative phage repressor  27.51 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0696097  normal  0.123244 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  26.96 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  27.39 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  26.18 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  38.46 
 
 		 225 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  25.83 
 
 		 264 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  29.51 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  26.18 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  27.36 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  27.43 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  27.04 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  27.12 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  34.59 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  25.86 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  29.37 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  25.88 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  26.94 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  26.94 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  26.94 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  31.52 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  30.65 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  29.37 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3391  putative prophage repressor  28.08 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711365  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  24.89 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  24.79 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  33.07 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  24.77 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  26.42 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  28.06 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  27.88 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  27.32 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0976  putative phage repressor  30 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.786838  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  25 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  26.8 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  25 
 
 		 264 aa  54.7  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  37.93 
 
 		 247 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1013  DNA-binding protein  27.09 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.149474  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  37.93 
 
 		 247 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1503  LexA repressor  27.78 
 
 		 239 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.106376 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  35.9 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0508  DNA-binding protein  28.95 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0116829  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  36.46 
 
 		 819 aa  53.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0818  transcriptional regulator  26.6 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.051861  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1440  signal peptidase I, putative  32.08 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  24.51 
 
 		 214 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  38.1 
 
 		 244 aa  52  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  28.24 
 
 		 230 aa  51.6  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0215  phage repressor protein, putative  28.99 
 
 		 209 aa  51.6  0.000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0406422  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  26.87 
 
 		 245 aa  51.6  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  35.07 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  23.45 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2281  putative phage repressor  25.9 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4500  putative phage repressor  30.43 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  25.96 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  36.71 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  22.69 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  25.63 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2676  putative phage repressor  27.21 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135442 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  34.33 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  34.33 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  34.33 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  34.33 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1124  putative phage repressor protein  28.65 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000298454  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  25.5 
 
 		 263 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  27.01 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  34.41 
 
 		 331 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0805  conserved hypothetical protein, putative peptidase S24  31.96 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  34.33 
 
 		 269 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  34.33 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  24.12 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  30.43 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  22.47 
 
 		 284 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  34.33 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0077  phage repressor like transcriptional regulator  26.09 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  32.14 
 
 		 273 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1207  transcriptional repressor, LexA family  29.83 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325213  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  34.33 
 
 		 269 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  22.27 
 
 		 270 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  27.45 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  26.67 
 
 		 238 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  25 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  27.56 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  22.69 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  32.03 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>