21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3391 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3391  putative prophage repressor  100 
 
 		 247 aa  508  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711365  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  28.26 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  28.08 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  26.03 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  26.03 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  26.67 
 
 		 227 aa  52.8  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  28.26 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  22.22 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0180  LexA repressor  30.33 
 
 		 205 aa  45.4  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  22.42 
 
 		 209 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  22.88 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2281  putative phage repressor  24.15 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  27.59 
 
 		 138 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1255  transcriptional regulator, XRE family  22.61 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0691404  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0200  LexA repressor  30.23 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1491  SOS mutagenesis protein UmuD  25.37 
 
 		 142 aa  43.9  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00671192  decreased coverage  0.0000906446 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  26.32 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  28.17 
 
 		 211 aa  42.7  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  24.82 
 
 		 270 aa  43.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  27.59 
 
 		 138 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  20.59 
 
 		 205 aa  42  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>