179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2924 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  100 
 
 
264 aa  541  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  98.86 
 
 
264 aa  533  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  36.02 
 
 
215 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  35.02 
 
 
240 aa  122  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  36.68 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  31.38 
 
 
225 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  35.45 
 
 
247 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  36.03 
 
 
230 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  29.86 
 
 
248 aa  110  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  34.75 
 
 
247 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  32.62 
 
 
251 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  29.95 
 
 
209 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  32.24 
 
 
244 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  41.01 
 
 
230 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  33.49 
 
 
256 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  31.43 
 
 
244 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  34.78 
 
 
235 aa  98.2  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  26.02 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  26.02 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  32.77 
 
 
227 aa  97.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  32.09 
 
 
229 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  33.02 
 
 
256 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  28.46 
 
 
238 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  28.33 
 
 
263 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  31.32 
 
 
236 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  42.86 
 
 
233 aa  89.7  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  30.29 
 
 
211 aa  89.7  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  31.12 
 
 
302 aa  89.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  40.24 
 
 
225 aa  89  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  29.29 
 
 
219 aa  88.6  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  34.59 
 
 
261 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  31.22 
 
 
239 aa  87  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  38.19 
 
 
193 aa  86.7  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  35.86 
 
 
231 aa  85.9  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  39.6 
 
 
222 aa  85.9  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  35.86 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  28.87 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  31.16 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  30.29 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  31.09 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  27.73 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  26.74 
 
 
259 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  30.96 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  29 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  26.69 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  26.79 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  34.56 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  28.27 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  29.87 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  37.23 
 
 
213 aa  79  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  27.85 
 
 
233 aa  79  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  29.87 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  25.52 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  29.05 
 
 
204 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  26.78 
 
 
241 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  27.85 
 
 
233 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  30.83 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  27.88 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  31.33 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  25.91 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  27.4 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  37.31 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  27.71 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  31.06 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  27.16 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  28.27 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  29.63 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  28.52 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  35.77 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  27.27 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  25.75 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  28.7 
 
 
220 aa  67  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  27.16 
 
 
240 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  25.75 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  30.83 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  32.33 
 
 
214 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  26.69 
 
 
214 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1866  putative phage repressor  30.97 
 
 
244 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  32.43 
 
 
289 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  25.41 
 
 
216 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  26.2 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  30.08 
 
 
219 aa  60.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  22.95 
 
 
213 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  23.6 
 
 
238 aa  60.1  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  23.6 
 
 
238 aa  60.1  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  25.6 
 
 
273 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  25.42 
 
 
243 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  25.64 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4549  putative phage repressor  28.93 
 
 
231 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0717  phage repressor  27.07 
 
 
239 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  41.1 
 
 
230 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  26.69 
 
 
248 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  29.41 
 
 
216 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  25.52 
 
 
218 aa  57  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0818  transcriptional regulator  23.83 
 
 
211 aa  56.6  0.0000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.051861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  26.5 
 
 
209 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3391  putative prophage repressor  26.03 
 
 
247 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711365  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  23.08 
 
 
216 aa  56.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  25.41 
 
 
244 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  25 
 
 
205 aa  54.7  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>